Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3C3Q8NEB9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3C3Q8NEB9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3C3Q8NEB9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3C3Q8NEB9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3C3Q8NEB9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3C3Q8NEB9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3C3Q8NEB9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3C3Q8NEB9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C3Q8NEB9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C3Q8NEB9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C3Q8NEB9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C3Q8NEB9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3C3Q8NEB9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C3Q8NEB9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C3Q8NEB9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C3Q8NEB9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3C3Q8NEB9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3C3Q8NEB9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3C3Q8NEB9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3C3Q8NEB9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3C3Q8NEB9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3C3Q8NEB9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3C3Q8NEB9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3C3Q8NEB9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3C3Q8NEB9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3C3Q8NEB9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIK3C3Q8NEB9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIK3C3Q8NEB9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PIK3C3Q8NEB9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PIK3C3Q8NEB9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PIK3C3Q8NEB9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PIK3C3Q8NEB9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3C3Q8NEB9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3C3Q8NEB9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3C3Q8NEB9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3C3Q8NEB9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIK3C3Q8NEB9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIK3C3Q8NEB9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIK3C3Q8NEB9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIK3C3Q8NEB9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3C3Q8NEB9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3C3Q8NEB9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3C3Q8NEB9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3C3Q8NEB9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3C3Q8NEB9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3C3Q8NEB9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3C3Q8NEB9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3C3Q8NEB9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3C3Q8NEB9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3C3Q8NEB9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3C3Q8NEB9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3C3Q8NEB9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3C3Q8NEB9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3C3Q8NEB9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3C3Q8NEB9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3C3Q8NEB9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3C3Q8NEB9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3C3Q8NEB9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3C3Q8NEB9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3C3Q8NEB9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3C3Q8NEB9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3C3Q8NEB9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3C3Q8NEB9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3C3Q8NEB9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C3Q8NEB9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3C3Q8NEB9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3C3Q8NEB9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3C3Q8NEB9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3C3Q8NEB9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3C3Q8NEB9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3C3Q8NEB9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3C3Q8NEB9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3C3Q8NEB9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3C3Q8NEB9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C3Q8NEB9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C3Q8NEB9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C3Q8NEB9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C3Q8NEB9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C3Q8NEB9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C3Q8NEB9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3C3Q8NEB9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3C3Q8NEB9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3C3Q8NEB9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3C3Q8NEB9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PIK3C3Q8NEB9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3C3Q8NEB9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C3Q8NEB9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3C3Q8NEB9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3C3Q8NEB9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3C3Q8NEB9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3C3Q8NEB9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3C3Q8NEB9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3C3Q8NEB9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3C3Q8NEB9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIK3C3Q8NEB9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms