Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC51

SERBP1, Plasminogen activator inhibitor 1 RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERBP1Q8NC51 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.619e-7■■■■■ 76.3
SERBP1Q8NC51 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.442e-9■■■■■ 76.3
SERBP1Q8NC51 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.584e-22■■■■■ 76.3
SERBP1Q8NC51 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.44e-22■■■■■ 76.3
SERBP1Q8NC51 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.352e-9■■■■■ 76.3
SERBP1Q8NC51 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.214e-22■■■■■ 76.3
SERBP1Q8NC51 RXRA-203ENST00000484822 5215 ntTSL 215.49■□□□□ 0.072e-9■■■■■ 76.3
SERBP1Q8NC51 LARP4B-207ENST00000476529 613 ntTSL 314.18□□□□□ -0.142e-9■■■■■ 76.3
SERBP1Q8NC51 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.234e-12■■■■■ 76.2
SERBP1Q8NC51 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.72e-7■■■■■ 75.9
SERBP1Q8NC51 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.983e-7■■■■■ 75.1
SERBP1Q8NC51 DDIT4-203ENST00000473155 753 ntTSL 1 (best)19.6■□□□□ 0.733e-7■■■■■ 75.1
SERBP1Q8NC51 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.243e-6■■■■■ 73.5
SERBP1Q8NC51 YWHAZ-213ENST00000492736 681 ntTSL 320.44■□□□□ 0.863e-8■■■■■ 73.1
SERBP1Q8NC51 YWHAZ-208ENST00000418997 996 ntTSL 219.71■□□□□ 0.753e-8■■■■■ 73.1
SERBP1Q8NC51 YWHAZ-221ENST00000523131 567 ntTSL 519.54■□□□□ 0.723e-8■■■■■ 73.1
SERBP1Q8NC51 YWHAZ-223ENST00000523938 626 ntTSL 519.47■□□□□ 0.713e-8■■■■■ 73.1
SERBP1Q8NC51 YWHAZ-210ENST00000437293 701 ntTSL 318.51■□□□□ 0.553e-8■■■■■ 73.1
SERBP1Q8NC51 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.233e-8■■■■■ 73.1
SERBP1Q8NC51 YWHAZ-207ENST00000395958 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.593e-8■■■■■ 73.1
SERBP1Q8NC51 YWHAZ-216ENST00000521309 1399 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.83e-8■■■■■ 73.1
SERBP1Q8NC51 YWHAZ-202ENST00000395948 812 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.873e-8■■■■■ 73.1
SERBP1Q8NC51 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.543e-8■■■■■ 73.1
SERBP1Q8NC51 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.553e-8■■■■■ 73.1
SERBP1Q8NC51 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.447e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 B4GALT2-207ENST00000497866 980 ntTSL 228.16■■■□□ 2.17e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.397e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.325e-13■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RNH1-217ENST00000529768 1019 ntTSL 221.82■■□□□ 1.087e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.997e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.987e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.947e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.947e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.97e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.897e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RNH1-210ENST00000525701 1794 ntTSL 520.61■□□□□ 0.897e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 GNB1L-204ENST00000453108 702 ntTSL 320.48■□□□□ 0.877e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.837e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.827e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.797e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.787e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.627e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RNH1-207ENST00000524464 624 ntTSL 518.03■□□□□ 0.487e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.487e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.447e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RTL10-204ENST00000416337 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.69■□□□□ 0.427e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 GNB1L-206ENST00000481086 854 ntTSL 317.69■□□□□ 0.427e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 GNB1L-205ENST00000460402 1197 ntTSL 317.47■□□□□ 0.397e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.337e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.37e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 UNC13D-212ENST00000589670 668 ntTSL 316.79■□□□□ 0.287e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.27e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 B4GALT2-208ENST00000498543 360 ntTSL 316.24■□□□□ 0.197e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 UNC13D-206ENST00000586519 403 ntTSL 516.18■□□□□ 0.187e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 YIF1B-210ENST00000589151 431 ntTSL 216.08■□□□□ 0.167e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.147e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.117e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.077e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.027e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 ZC3H18-204ENST00000564161 4654 ntTSL 214.66□□□□□ -0.067e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.127e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.127e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.137e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.157e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.157e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.287e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.287e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RNH1-209ENST00000525522 3281 ntTSL 1 (best)13.18□□□□□ -0.37e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RTL10-205ENST00000484072 1385 ntTSL 213.16□□□□□ -0.37e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 TLN1-203ENST00000464379 814 ntTSL 313.15□□□□□ -0.37e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.317e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.327e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 ZC3H18-210ENST00000567085 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.89□□□□□ -0.517e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 GCN1-201ENST00000300648 8675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.557e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 C7orf71-202ENST00000614528 1963 ntTSL 1 (best)11.26□□□□□ -0.617e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RTL10-203ENST00000407472 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.697e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 SATB2-207ENST00000463386 372 ntTSL 410.41□□□□□ -0.747e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.857e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 C7orf71-201ENST00000409974 1956 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.967e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 ABO-201ENST00000453660 6341 ntTSL 1 (best)13.42□□□□□ -0.262e-8■■■■■ 72.1
SERBP1Q8NC51 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.544e-29■■■■■ 71.7
SERBP1Q8NC51 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.364e-29■■■■■ 71.7
SERBP1Q8NC51 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.354e-29■■■■■ 71.7
SERBP1Q8NC51 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.184e-29■■■■■ 71.7
SERBP1Q8NC51 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.124e-29■■■■■ 71.7
SERBP1Q8NC51 AP2A1-205ENST00000597774 2196 ntTSL 518.21■□□□□ 0.511e-7■■■■■ 71.4
SERBP1Q8NC51 AP2A1-202ENST00000359032 3286 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 71.4
SERBP1Q8NC51 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.228e-8■■■■■ 71.2
SERBP1Q8NC51 BAG6-262ENST00000470875 1000 ntTSL 521.11■□□□□ 0.979e-8■■■■■ 69.9
SERBP1Q8NC51 EPPK1-201ENST00000568225 15530 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.64e-6■■■■■ 69.9
SERBP1Q8NC51 EPPK1-202ENST00000615648 16002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.784e-6■■■■■ 69.9
SERBP1Q8NC51 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.493e-6■■■■■ 69.5
SERBP1Q8NC51 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.753e-6■■■■■ 69.5
SERBP1Q8NC51 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 69.5
SERBP1Q8NC51 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.663e-6■■■■■ 69.5
SERBP1Q8NC51 CAPZB-207ENST00000459967 579 ntTSL 316.33■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 69.5
SERBP1Q8NC51 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 69.5
SERBP1Q8NC51 CAPZB-208ENST00000482808 660 ntTSL 214.47□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 69.5
SERBP1Q8NC51 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 69.5
SERBP1Q8NC51 TEX22-202ENST00000548638 508 ntTSL 511.39□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 69.5
Retrieved 100 of 2,723 protein–RNA pairs in 211.3 ms