Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBM4

UBAC2, Ubiquitin-associated domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAC2Q8NBM4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBAC2Q8NBM4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBAC2Q8NBM4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBAC2Q8NBM4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBAC2Q8NBM4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBAC2Q8NBM4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBAC2Q8NBM4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UBAC2Q8NBM4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBAC2Q8NBM4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBAC2Q8NBM4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBAC2Q8NBM4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBAC2Q8NBM4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBAC2Q8NBM4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBAC2Q8NBM4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBAC2Q8NBM4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBAC2Q8NBM4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBAC2Q8NBM4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBAC2Q8NBM4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBAC2Q8NBM4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAC2Q8NBM4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAC2Q8NBM4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAC2Q8NBM4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAC2Q8NBM4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAC2Q8NBM4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAC2Q8NBM4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAC2Q8NBM4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBAC2Q8NBM4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAC2Q8NBM4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBAC2Q8NBM4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBAC2Q8NBM4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBAC2Q8NBM4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAC2Q8NBM4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBAC2Q8NBM4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBAC2Q8NBM4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBAC2Q8NBM4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBAC2Q8NBM4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBAC2Q8NBM4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBAC2Q8NBM4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAC2Q8NBM4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBAC2Q8NBM4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBAC2Q8NBM4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBAC2Q8NBM4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBAC2Q8NBM4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBAC2Q8NBM4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBAC2Q8NBM4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBAC2Q8NBM4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBAC2Q8NBM4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBAC2Q8NBM4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBAC2Q8NBM4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBAC2Q8NBM4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBAC2Q8NBM4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBAC2Q8NBM4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBAC2Q8NBM4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBAC2Q8NBM4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBAC2Q8NBM4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBAC2Q8NBM4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBAC2Q8NBM4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBAC2Q8NBM4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBAC2Q8NBM4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBAC2Q8NBM4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBAC2Q8NBM4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBAC2Q8NBM4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBAC2Q8NBM4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBAC2Q8NBM4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBAC2Q8NBM4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBAC2Q8NBM4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBAC2Q8NBM4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBAC2Q8NBM4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBAC2Q8NBM4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBAC2Q8NBM4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBAC2Q8NBM4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBAC2Q8NBM4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBAC2Q8NBM4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBAC2Q8NBM4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBAC2Q8NBM4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBAC2Q8NBM4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBAC2Q8NBM4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBAC2Q8NBM4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBAC2Q8NBM4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBAC2Q8NBM4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBAC2Q8NBM4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBAC2Q8NBM4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBAC2Q8NBM4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBAC2Q8NBM4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBAC2Q8NBM4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBAC2Q8NBM4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBAC2Q8NBM4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBAC2Q8NBM4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBAC2Q8NBM4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBAC2Q8NBM4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBAC2Q8NBM4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBAC2Q8NBM4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBAC2Q8NBM4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBAC2Q8NBM4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBAC2Q8NBM4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBAC2Q8NBM4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBAC2Q8NBM4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBAC2Q8NBM4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBAC2Q8NBM4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBAC2Q8NBM4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms