Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF4

Putative uncharacterized protein FLJ33307, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8NBF4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8NBF4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8NBF4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8NBF4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8NBF4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8NBF4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8NBF4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8NBF4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8NBF4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8NBF4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8NBF4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8NBF4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8NBF4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8NBF4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8NBF4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8NBF4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8NBF4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8NBF4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8NBF4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8NBF4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8NBF4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8NBF4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8NBF4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8NBF4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8NBF4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8NBF4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8NBF4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8NBF4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8NBF4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8NBF4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8NBF4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8NBF4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8NBF4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8NBF4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8NBF4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8NBF4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8NBF4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8NBF4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q8NBF4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8NBF4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8NBF4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8NBF4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8NBF4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8NBF4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8NBF4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8NBF4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8NBF4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8NBF4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8NBF4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8NBF4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8NBF4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8NBF4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8NBF4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8NBF4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8NBF4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8NBF4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8NBF4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8NBF4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8NBF4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8NBF4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8NBF4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8NBF4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8NBF4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8NBF4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8NBF4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8NBF4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8NBF4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8NBF4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8NBF4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8NBF4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8NBF4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8NBF4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8NBF4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8NBF4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8NBF4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8NBF4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8NBF4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8NBF4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q8NBF4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8NBF4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8NBF4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8NBF4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8NBF4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8NBF4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8NBF4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8NBF4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8NBF4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8NBF4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8NBF4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8NBF4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8NBF4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q8NBF4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q8NBF4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q8NBF4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q8NBF4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8NBF4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q8NBF4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q8NBF4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8NBF4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8NBF4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms