Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L4

SPEM1, Spermatid maturation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEM1Q8N4L4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPEM1Q8N4L4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPEM1Q8N4L4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SPEM1Q8N4L4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPEM1Q8N4L4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPEM1Q8N4L4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPEM1Q8N4L4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPEM1Q8N4L4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPEM1Q8N4L4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPEM1Q8N4L4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPEM1Q8N4L4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPEM1Q8N4L4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPEM1Q8N4L4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPEM1Q8N4L4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPEM1Q8N4L4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPEM1Q8N4L4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPEM1Q8N4L4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPEM1Q8N4L4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPEM1Q8N4L4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPEM1Q8N4L4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPEM1Q8N4L4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPEM1Q8N4L4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPEM1Q8N4L4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPEM1Q8N4L4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPEM1Q8N4L4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPEM1Q8N4L4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPEM1Q8N4L4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPEM1Q8N4L4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPEM1Q8N4L4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SPEM1Q8N4L4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPEM1Q8N4L4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPEM1Q8N4L4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPEM1Q8N4L4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPEM1Q8N4L4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPEM1Q8N4L4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPEM1Q8N4L4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPEM1Q8N4L4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPEM1Q8N4L4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPEM1Q8N4L4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPEM1Q8N4L4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPEM1Q8N4L4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPEM1Q8N4L4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPEM1Q8N4L4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPEM1Q8N4L4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPEM1Q8N4L4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPEM1Q8N4L4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPEM1Q8N4L4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SPEM1Q8N4L4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPEM1Q8N4L4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SPEM1Q8N4L4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPEM1Q8N4L4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPEM1Q8N4L4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SPEM1Q8N4L4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SPEM1Q8N4L4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPEM1Q8N4L4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPEM1Q8N4L4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SPEM1Q8N4L4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SPEM1Q8N4L4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPEM1Q8N4L4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPEM1Q8N4L4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPEM1Q8N4L4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPEM1Q8N4L4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPEM1Q8N4L4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPEM1Q8N4L4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPEM1Q8N4L4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPEM1Q8N4L4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPEM1Q8N4L4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPEM1Q8N4L4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPEM1Q8N4L4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SPEM1Q8N4L4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPEM1Q8N4L4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPEM1Q8N4L4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPEM1Q8N4L4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPEM1Q8N4L4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SPEM1Q8N4L4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SPEM1Q8N4L4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPEM1Q8N4L4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPEM1Q8N4L4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPEM1Q8N4L4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPEM1Q8N4L4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPEM1Q8N4L4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPEM1Q8N4L4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPEM1Q8N4L4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SPEM1Q8N4L4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPEM1Q8N4L4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPEM1Q8N4L4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPEM1Q8N4L4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPEM1Q8N4L4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SPEM1Q8N4L4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPEM1Q8N4L4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPEM1Q8N4L4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPEM1Q8N4L4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPEM1Q8N4L4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPEM1Q8N4L4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPEM1Q8N4L4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPEM1Q8N4L4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPEM1Q8N4L4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPEM1Q8N4L4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPEM1Q8N4L4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPEM1Q8N4L4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms