Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
P3H3Q8IVL6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC44■■■■■ 4.63
P3H3Q8IVL6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC43.98■■■■■ 4.63
P3H3Q8IVL6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
P3H3Q8IVL6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
P3H3Q8IVL6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
P3H3Q8IVL6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
P3H3Q8IVL6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
P3H3Q8IVL6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
P3H3Q8IVL6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
P3H3Q8IVL6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.62
P3H3Q8IVL6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
P3H3Q8IVL6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
P3H3Q8IVL6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
P3H3Q8IVL6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
P3H3Q8IVL6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
P3H3Q8IVL6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
P3H3Q8IVL6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
P3H3Q8IVL6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
P3H3Q8IVL6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
P3H3Q8IVL6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC43.82■■■■■ 4.61
P3H3Q8IVL6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC43.82■■■■■ 4.61
P3H3Q8IVL6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
P3H3Q8IVL6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
P3H3Q8IVL6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
P3H3Q8IVL6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC43.79■■■■■ 4.6
P3H3Q8IVL6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
P3H3Q8IVL6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
P3H3Q8IVL6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC43.72■■■■■ 4.59
P3H3Q8IVL6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
P3H3Q8IVL6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
P3H3Q8IVL6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
P3H3Q8IVL6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
P3H3Q8IVL6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC43.7■■■■■ 4.59
P3H3Q8IVL6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC43.7■■■■■ 4.59
P3H3Q8IVL6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
P3H3Q8IVL6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
P3H3Q8IVL6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
P3H3Q8IVL6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
P3H3Q8IVL6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
P3H3Q8IVL6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
P3H3Q8IVL6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
P3H3Q8IVL6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
P3H3Q8IVL6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC43.63■■■■■ 4.57
P3H3Q8IVL6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
P3H3Q8IVL6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
P3H3Q8IVL6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
P3H3Q8IVL6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
P3H3Q8IVL6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
P3H3Q8IVL6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC43.62■■■■■ 4.57
P3H3Q8IVL6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
P3H3Q8IVL6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
P3H3Q8IVL6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC43.6■■■■■ 4.57
P3H3Q8IVL6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
P3H3Q8IVL6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
P3H3Q8IVL6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
P3H3Q8IVL6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC43.57■■■■■ 4.57
P3H3Q8IVL6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
P3H3Q8IVL6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
P3H3Q8IVL6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
P3H3Q8IVL6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC43.55■■■■■ 4.56
P3H3Q8IVL6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC43.55■■■■■ 4.56
P3H3Q8IVL6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC43.55■■■■■ 4.56
P3H3Q8IVL6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
P3H3Q8IVL6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
P3H3Q8IVL6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
P3H3Q8IVL6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
P3H3Q8IVL6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
P3H3Q8IVL6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
P3H3Q8IVL6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
P3H3Q8IVL6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC43.45■■■■■ 4.55
P3H3Q8IVL6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC43.44■■■■■ 4.54
P3H3Q8IVL6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.54
P3H3Q8IVL6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
P3H3Q8IVL6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
P3H3Q8IVL6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
P3H3Q8IVL6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
P3H3Q8IVL6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC43.42■■■■■ 4.54
P3H3Q8IVL6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
P3H3Q8IVL6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
P3H3Q8IVL6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
P3H3Q8IVL6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
P3H3Q8IVL6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
P3H3Q8IVL6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC43.37■■■■■ 4.53
P3H3Q8IVL6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
P3H3Q8IVL6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
P3H3Q8IVL6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
P3H3Q8IVL6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
P3H3Q8IVL6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
P3H3Q8IVL6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
P3H3Q8IVL6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC43.31■■■■■ 4.52
P3H3Q8IVL6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
P3H3Q8IVL6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
P3H3Q8IVL6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
P3H3Q8IVL6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC43.25■■■■■ 4.51
P3H3Q8IVL6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC43.23■■■■■ 4.51
P3H3Q8IVL6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
P3H3Q8IVL6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
P3H3Q8IVL6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
P3H3Q8IVL6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms