Protein–RNA interactions for Protein: Q86YH6

PDSS2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS2Q86YH6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDSS2Q86YH6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDSS2Q86YH6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDSS2Q86YH6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDSS2Q86YH6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDSS2Q86YH6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDSS2Q86YH6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDSS2Q86YH6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDSS2Q86YH6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDSS2Q86YH6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDSS2Q86YH6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDSS2Q86YH6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDSS2Q86YH6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDSS2Q86YH6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDSS2Q86YH6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDSS2Q86YH6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDSS2Q86YH6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDSS2Q86YH6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDSS2Q86YH6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDSS2Q86YH6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDSS2Q86YH6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDSS2Q86YH6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDSS2Q86YH6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDSS2Q86YH6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDSS2Q86YH6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDSS2Q86YH6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDSS2Q86YH6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PDSS2Q86YH6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDSS2Q86YH6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDSS2Q86YH6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDSS2Q86YH6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDSS2Q86YH6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDSS2Q86YH6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDSS2Q86YH6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDSS2Q86YH6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PDSS2Q86YH6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDSS2Q86YH6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDSS2Q86YH6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDSS2Q86YH6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDSS2Q86YH6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDSS2Q86YH6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDSS2Q86YH6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDSS2Q86YH6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDSS2Q86YH6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDSS2Q86YH6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDSS2Q86YH6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDSS2Q86YH6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDSS2Q86YH6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDSS2Q86YH6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDSS2Q86YH6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDSS2Q86YH6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDSS2Q86YH6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDSS2Q86YH6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDSS2Q86YH6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PDSS2Q86YH6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDSS2Q86YH6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDSS2Q86YH6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDSS2Q86YH6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDSS2Q86YH6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDSS2Q86YH6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDSS2Q86YH6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDSS2Q86YH6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDSS2Q86YH6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDSS2Q86YH6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDSS2Q86YH6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDSS2Q86YH6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDSS2Q86YH6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDSS2Q86YH6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDSS2Q86YH6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDSS2Q86YH6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PDSS2Q86YH6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PDSS2Q86YH6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDSS2Q86YH6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDSS2Q86YH6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDSS2Q86YH6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDSS2Q86YH6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDSS2Q86YH6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDSS2Q86YH6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PDSS2Q86YH6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDSS2Q86YH6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PDSS2Q86YH6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDSS2Q86YH6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDSS2Q86YH6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDSS2Q86YH6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDSS2Q86YH6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDSS2Q86YH6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDSS2Q86YH6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDSS2Q86YH6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDSS2Q86YH6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDSS2Q86YH6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDSS2Q86YH6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDSS2Q86YH6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDSS2Q86YH6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDSS2Q86YH6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDSS2Q86YH6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDSS2Q86YH6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDSS2Q86YH6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDSS2Q86YH6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PDSS2Q86YH6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PDSS2Q86YH6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms