Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLNKQ7Z7G1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CLNKQ7Z7G1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLNKQ7Z7G1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CLNKQ7Z7G1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLNKQ7Z7G1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLNKQ7Z7G1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLNKQ7Z7G1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLNKQ7Z7G1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLNKQ7Z7G1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLNKQ7Z7G1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLNKQ7Z7G1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLNKQ7Z7G1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLNKQ7Z7G1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLNKQ7Z7G1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLNKQ7Z7G1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLNKQ7Z7G1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLNKQ7Z7G1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLNKQ7Z7G1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLNKQ7Z7G1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLNKQ7Z7G1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLNKQ7Z7G1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLNKQ7Z7G1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLNKQ7Z7G1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLNKQ7Z7G1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLNKQ7Z7G1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLNKQ7Z7G1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLNKQ7Z7G1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLNKQ7Z7G1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLNKQ7Z7G1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLNKQ7Z7G1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLNKQ7Z7G1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLNKQ7Z7G1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLNKQ7Z7G1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLNKQ7Z7G1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLNKQ7Z7G1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLNKQ7Z7G1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLNKQ7Z7G1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLNKQ7Z7G1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLNKQ7Z7G1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLNKQ7Z7G1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLNKQ7Z7G1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLNKQ7Z7G1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLNKQ7Z7G1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLNKQ7Z7G1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLNKQ7Z7G1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLNKQ7Z7G1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLNKQ7Z7G1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLNKQ7Z7G1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLNKQ7Z7G1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLNKQ7Z7G1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLNKQ7Z7G1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLNKQ7Z7G1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLNKQ7Z7G1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLNKQ7Z7G1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLNKQ7Z7G1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLNKQ7Z7G1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLNKQ7Z7G1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLNKQ7Z7G1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLNKQ7Z7G1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLNKQ7Z7G1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLNKQ7Z7G1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLNKQ7Z7G1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLNKQ7Z7G1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLNKQ7Z7G1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLNKQ7Z7G1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLNKQ7Z7G1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLNKQ7Z7G1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLNKQ7Z7G1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLNKQ7Z7G1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLNKQ7Z7G1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLNKQ7Z7G1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLNKQ7Z7G1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLNKQ7Z7G1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLNKQ7Z7G1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLNKQ7Z7G1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLNKQ7Z7G1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLNKQ7Z7G1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLNKQ7Z7G1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLNKQ7Z7G1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLNKQ7Z7G1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLNKQ7Z7G1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLNKQ7Z7G1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLNKQ7Z7G1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLNKQ7Z7G1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CLNKQ7Z7G1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLNKQ7Z7G1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLNKQ7Z7G1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLNKQ7Z7G1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLNKQ7Z7G1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLNKQ7Z7G1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLNKQ7Z7G1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLNKQ7Z7G1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLNKQ7Z7G1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLNKQ7Z7G1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLNKQ7Z7G1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLNKQ7Z7G1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLNKQ7Z7G1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLNKQ7Z7G1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLNKQ7Z7G1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms