Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z478

DHX29, ATP-dependent RNA helicase DHX29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX29Q7Z478 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
DHX29Q7Z478 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
DHX29Q7Z478 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
DHX29Q7Z478 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
DHX29Q7Z478 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
DHX29Q7Z478 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
DHX29Q7Z478 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
DHX29Q7Z478 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
DHX29Q7Z478 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
DHX29Q7Z478 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
DHX29Q7Z478 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
DHX29Q7Z478 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
DHX29Q7Z478 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
DHX29Q7Z478 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
DHX29Q7Z478 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
DHX29Q7Z478 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
DHX29Q7Z478 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
DHX29Q7Z478 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
DHX29Q7Z478 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
DHX29Q7Z478 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
DHX29Q7Z478 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
DHX29Q7Z478 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC41.13■■■■■ 4.18
DHX29Q7Z478 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
DHX29Q7Z478 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
DHX29Q7Z478 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC41.08■■■■■ 4.17
DHX29Q7Z478 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.16
DHX29Q7Z478 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
DHX29Q7Z478 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
DHX29Q7Z478 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
DHX29Q7Z478 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
DHX29Q7Z478 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
DHX29Q7Z478 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
DHX29Q7Z478 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
DHX29Q7Z478 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
DHX29Q7Z478 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
DHX29Q7Z478 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
DHX29Q7Z478 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
DHX29Q7Z478 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
DHX29Q7Z478 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
DHX29Q7Z478 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
DHX29Q7Z478 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
DHX29Q7Z478 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
DHX29Q7Z478 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
DHX29Q7Z478 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
DHX29Q7Z478 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.9■■■■■ 4.14
DHX29Q7Z478 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
DHX29Q7Z478 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
DHX29Q7Z478 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
DHX29Q7Z478 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
DHX29Q7Z478 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.86■■■■■ 4.13
DHX29Q7Z478 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
DHX29Q7Z478 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
DHX29Q7Z478 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
DHX29Q7Z478 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
DHX29Q7Z478 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
DHX29Q7Z478 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC40.83■■■■■ 4.13
DHX29Q7Z478 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
DHX29Q7Z478 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
DHX29Q7Z478 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
DHX29Q7Z478 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
DHX29Q7Z478 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
DHX29Q7Z478 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
DHX29Q7Z478 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
DHX29Q7Z478 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
DHX29Q7Z478 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
DHX29Q7Z478 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
DHX29Q7Z478 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
DHX29Q7Z478 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
DHX29Q7Z478 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
DHX29Q7Z478 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
DHX29Q7Z478 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
DHX29Q7Z478 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
DHX29Q7Z478 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.69■■■■■ 4.1
DHX29Q7Z478 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
DHX29Q7Z478 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
DHX29Q7Z478 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
DHX29Q7Z478 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
DHX29Q7Z478 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
DHX29Q7Z478 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
DHX29Q7Z478 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
DHX29Q7Z478 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
DHX29Q7Z478 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
DHX29Q7Z478 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
DHX29Q7Z478 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
DHX29Q7Z478 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.08
DHX29Q7Z478 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
DHX29Q7Z478 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
DHX29Q7Z478 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
DHX29Q7Z478 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
DHX29Q7Z478 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
DHX29Q7Z478 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
DHX29Q7Z478 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
DHX29Q7Z478 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
DHX29Q7Z478 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
DHX29Q7Z478 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
DHX29Q7Z478 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
DHX29Q7Z478 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
DHX29Q7Z478 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
DHX29Q7Z478 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
DHX29Q7Z478 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms