Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.88
CLASP1Q7Z460 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC45.56■■■■■ 4.88
CLASP1Q7Z460 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
CLASP1Q7Z460 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.53■■■■■ 4.88
CLASP1Q7Z460 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
CLASP1Q7Z460 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
CLASP1Q7Z460 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
CLASP1Q7Z460 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC45.47■■■■■ 4.87
CLASP1Q7Z460 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.47■■■■■ 4.87
CLASP1Q7Z460 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.46■■■■■ 4.87
CLASP1Q7Z460 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
CLASP1Q7Z460 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
CLASP1Q7Z460 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC45.42■■■■■ 4.86
CLASP1Q7Z460 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
CLASP1Q7Z460 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC45.39■■■■■ 4.86
CLASP1Q7Z460 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
CLASP1Q7Z460 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC45.37■■■■■ 4.85
CLASP1Q7Z460 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
CLASP1Q7Z460 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC45.36■■■■■ 4.85
CLASP1Q7Z460 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC45.33■■■■■ 4.85
CLASP1Q7Z460 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC45.31■■■■■ 4.84
CLASP1Q7Z460 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC45.31■■■■■ 4.84
CLASP1Q7Z460 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
CLASP1Q7Z460 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC45.3■■■■■ 4.84
CLASP1Q7Z460 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC45.3■■■■■ 4.84
CLASP1Q7Z460 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC45.3■■■■■ 4.84
CLASP1Q7Z460 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
CLASP1Q7Z460 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
CLASP1Q7Z460 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC45.27■■■■■ 4.84
CLASP1Q7Z460 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
CLASP1Q7Z460 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
CLASP1Q7Z460 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC45.25■■■■■ 4.83
CLASP1Q7Z460 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC45.24■■■■■ 4.83
CLASP1Q7Z460 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC45.23■■■■■ 4.83
CLASP1Q7Z460 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
CLASP1Q7Z460 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
CLASP1Q7Z460 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
CLASP1Q7Z460 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
CLASP1Q7Z460 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC45.18■■■■■ 4.82
CLASP1Q7Z460 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
CLASP1Q7Z460 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
CLASP1Q7Z460 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
CLASP1Q7Z460 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC45.14■■■■■ 4.82
CLASP1Q7Z460 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.12■■■■■ 4.81
CLASP1Q7Z460 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC45.12■■■■■ 4.81
CLASP1Q7Z460 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
CLASP1Q7Z460 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
CLASP1Q7Z460 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
CLASP1Q7Z460 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC45.05■■■■■ 4.8
CLASP1Q7Z460 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC45.04■■■■■ 4.8
CLASP1Q7Z460 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
CLASP1Q7Z460 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC45.02■■■■■ 4.8
CLASP1Q7Z460 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
CLASP1Q7Z460 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
CLASP1Q7Z460 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.01■■■■■ 4.8
CLASP1Q7Z460 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC44.99■■■■■ 4.79
CLASP1Q7Z460 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
CLASP1Q7Z460 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
CLASP1Q7Z460 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
CLASP1Q7Z460 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
CLASP1Q7Z460 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
CLASP1Q7Z460 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.96■■■■■ 4.79
CLASP1Q7Z460 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC44.94■■■■■ 4.78
CLASP1Q7Z460 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
CLASP1Q7Z460 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC44.9■■■■■ 4.78
CLASP1Q7Z460 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC44.9■■■■■ 4.78
CLASP1Q7Z460 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC44.9■■■■■ 4.78
CLASP1Q7Z460 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC44.85■■■■■ 4.77
CLASP1Q7Z460 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC44.85■■■■■ 4.77
CLASP1Q7Z460 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
CLASP1Q7Z460 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.85■■■■■ 4.77
CLASP1Q7Z460 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC44.85■■■■■ 4.77
CLASP1Q7Z460 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
CLASP1Q7Z460 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
CLASP1Q7Z460 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
CLASP1Q7Z460 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
CLASP1Q7Z460 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
CLASP1Q7Z460 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
CLASP1Q7Z460 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
CLASP1Q7Z460 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
CLASP1Q7Z460 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC44.8■■■■■ 4.76
CLASP1Q7Z460 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
CLASP1Q7Z460 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
CLASP1Q7Z460 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
CLASP1Q7Z460 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC44.76■■■■■ 4.76
CLASP1Q7Z460 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC44.76■■■■■ 4.76
CLASP1Q7Z460 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC44.75■■■■■ 4.76
CLASP1Q7Z460 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
CLASP1Q7Z460 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
CLASP1Q7Z460 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
CLASP1Q7Z460 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
CLASP1Q7Z460 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
CLASP1Q7Z460 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
CLASP1Q7Z460 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
CLASP1Q7Z460 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
CLASP1Q7Z460 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC44.72■■■■■ 4.75
CLASP1Q7Z460 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC44.72■■■■■ 4.75
CLASP1Q7Z460 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC44.71■■■■■ 4.75
CLASP1Q7Z460 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.7■■■■■ 4.75
CLASP1Q7Z460 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms