Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM47EQ6ZV65 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM47EQ6ZV65 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM47EQ6ZV65 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM47EQ6ZV65 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM47EQ6ZV65 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM47EQ6ZV65 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM47EQ6ZV65 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM47EQ6ZV65 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM47EQ6ZV65 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM47EQ6ZV65 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM47EQ6ZV65 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM47EQ6ZV65 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM47EQ6ZV65 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM47EQ6ZV65 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM47EQ6ZV65 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM47EQ6ZV65 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM47EQ6ZV65 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM47EQ6ZV65 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
FAM47EQ6ZV65 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FAM47EQ6ZV65 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM47EQ6ZV65 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM47EQ6ZV65 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM47EQ6ZV65 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM47EQ6ZV65 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM47EQ6ZV65 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM47EQ6ZV65 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM47EQ6ZV65 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM47EQ6ZV65 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM47EQ6ZV65 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM47EQ6ZV65 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM47EQ6ZV65 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM47EQ6ZV65 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FAM47EQ6ZV65 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM47EQ6ZV65 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM47EQ6ZV65 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM47EQ6ZV65 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM47EQ6ZV65 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM47EQ6ZV65 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM47EQ6ZV65 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM47EQ6ZV65 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM47EQ6ZV65 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM47EQ6ZV65 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM47EQ6ZV65 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM47EQ6ZV65 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM47EQ6ZV65 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM47EQ6ZV65 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM47EQ6ZV65 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM47EQ6ZV65 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM47EQ6ZV65 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM47EQ6ZV65 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM47EQ6ZV65 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM47EQ6ZV65 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM47EQ6ZV65 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM47EQ6ZV65 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM47EQ6ZV65 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM47EQ6ZV65 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM47EQ6ZV65 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM47EQ6ZV65 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM47EQ6ZV65 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM47EQ6ZV65 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM47EQ6ZV65 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM47EQ6ZV65 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
FAM47EQ6ZV65 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM47EQ6ZV65 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM47EQ6ZV65 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM47EQ6ZV65 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM47EQ6ZV65 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM47EQ6ZV65 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM47EQ6ZV65 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM47EQ6ZV65 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM47EQ6ZV65 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM47EQ6ZV65 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM47EQ6ZV65 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM47EQ6ZV65 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM47EQ6ZV65 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM47EQ6ZV65 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM47EQ6ZV65 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM47EQ6ZV65 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM47EQ6ZV65 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM47EQ6ZV65 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM47EQ6ZV65 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM47EQ6ZV65 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM47EQ6ZV65 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM47EQ6ZV65 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM47EQ6ZV65 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM47EQ6ZV65 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM47EQ6ZV65 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM47EQ6ZV65 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM47EQ6ZV65 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FAM47EQ6ZV65 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FAM47EQ6ZV65 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FAM47EQ6ZV65 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FAM47EQ6ZV65 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FAM47EQ6ZV65 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM47EQ6ZV65 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM47EQ6ZV65 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM47EQ6ZV65 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM47EQ6ZV65 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM47EQ6ZV65 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms