Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIAT1Q6ZQX7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIAT1Q6ZQX7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIAT1Q6ZQX7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIAT1Q6ZQX7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIAT1Q6ZQX7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIAT1Q6ZQX7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIAT1Q6ZQX7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIAT1Q6ZQX7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIAT1Q6ZQX7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIAT1Q6ZQX7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIAT1Q6ZQX7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIAT1Q6ZQX7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LIAT1Q6ZQX7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIAT1Q6ZQX7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIAT1Q6ZQX7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIAT1Q6ZQX7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIAT1Q6ZQX7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIAT1Q6ZQX7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIAT1Q6ZQX7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIAT1Q6ZQX7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIAT1Q6ZQX7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIAT1Q6ZQX7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIAT1Q6ZQX7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIAT1Q6ZQX7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIAT1Q6ZQX7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LIAT1Q6ZQX7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIAT1Q6ZQX7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIAT1Q6ZQX7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIAT1Q6ZQX7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIAT1Q6ZQX7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIAT1Q6ZQX7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIAT1Q6ZQX7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIAT1Q6ZQX7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIAT1Q6ZQX7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIAT1Q6ZQX7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIAT1Q6ZQX7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIAT1Q6ZQX7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIAT1Q6ZQX7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIAT1Q6ZQX7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIAT1Q6ZQX7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIAT1Q6ZQX7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIAT1Q6ZQX7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIAT1Q6ZQX7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIAT1Q6ZQX7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIAT1Q6ZQX7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIAT1Q6ZQX7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIAT1Q6ZQX7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIAT1Q6ZQX7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIAT1Q6ZQX7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIAT1Q6ZQX7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIAT1Q6ZQX7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIAT1Q6ZQX7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIAT1Q6ZQX7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIAT1Q6ZQX7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIAT1Q6ZQX7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIAT1Q6ZQX7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIAT1Q6ZQX7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIAT1Q6ZQX7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIAT1Q6ZQX7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIAT1Q6ZQX7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIAT1Q6ZQX7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIAT1Q6ZQX7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIAT1Q6ZQX7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIAT1Q6ZQX7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIAT1Q6ZQX7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIAT1Q6ZQX7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIAT1Q6ZQX7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LIAT1Q6ZQX7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIAT1Q6ZQX7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIAT1Q6ZQX7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIAT1Q6ZQX7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIAT1Q6ZQX7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIAT1Q6ZQX7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIAT1Q6ZQX7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIAT1Q6ZQX7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LIAT1Q6ZQX7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIAT1Q6ZQX7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIAT1Q6ZQX7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIAT1Q6ZQX7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIAT1Q6ZQX7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIAT1Q6ZQX7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIAT1Q6ZQX7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIAT1Q6ZQX7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIAT1Q6ZQX7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIAT1Q6ZQX7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIAT1Q6ZQX7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LIAT1Q6ZQX7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIAT1Q6ZQX7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIAT1Q6ZQX7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIAT1Q6ZQX7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIAT1Q6ZQX7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIAT1Q6ZQX7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIAT1Q6ZQX7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIAT1Q6ZQX7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIAT1Q6ZQX7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIAT1Q6ZQX7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIAT1Q6ZQX7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIAT1Q6ZQX7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIAT1Q6ZQX7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms