Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMBOX1Q6NT76 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMBOX1Q6NT76 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMBOX1Q6NT76 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMBOX1Q6NT76 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMBOX1Q6NT76 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMBOX1Q6NT76 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMBOX1Q6NT76 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMBOX1Q6NT76 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMBOX1Q6NT76 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HMBOX1Q6NT76 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMBOX1Q6NT76 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMBOX1Q6NT76 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMBOX1Q6NT76 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMBOX1Q6NT76 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMBOX1Q6NT76 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMBOX1Q6NT76 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMBOX1Q6NT76 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMBOX1Q6NT76 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMBOX1Q6NT76 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMBOX1Q6NT76 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMBOX1Q6NT76 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMBOX1Q6NT76 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMBOX1Q6NT76 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMBOX1Q6NT76 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMBOX1Q6NT76 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMBOX1Q6NT76 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMBOX1Q6NT76 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMBOX1Q6NT76 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMBOX1Q6NT76 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMBOX1Q6NT76 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMBOX1Q6NT76 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMBOX1Q6NT76 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMBOX1Q6NT76 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMBOX1Q6NT76 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HMBOX1Q6NT76 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMBOX1Q6NT76 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMBOX1Q6NT76 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMBOX1Q6NT76 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMBOX1Q6NT76 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMBOX1Q6NT76 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMBOX1Q6NT76 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMBOX1Q6NT76 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMBOX1Q6NT76 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMBOX1Q6NT76 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMBOX1Q6NT76 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMBOX1Q6NT76 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMBOX1Q6NT76 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HMBOX1Q6NT76 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMBOX1Q6NT76 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMBOX1Q6NT76 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMBOX1Q6NT76 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HMBOX1Q6NT76 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMBOX1Q6NT76 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMBOX1Q6NT76 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMBOX1Q6NT76 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMBOX1Q6NT76 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMBOX1Q6NT76 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMBOX1Q6NT76 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMBOX1Q6NT76 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMBOX1Q6NT76 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMBOX1Q6NT76 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMBOX1Q6NT76 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMBOX1Q6NT76 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMBOX1Q6NT76 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMBOX1Q6NT76 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMBOX1Q6NT76 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMBOX1Q6NT76 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMBOX1Q6NT76 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMBOX1Q6NT76 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMBOX1Q6NT76 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMBOX1Q6NT76 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HMBOX1Q6NT76 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMBOX1Q6NT76 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMBOX1Q6NT76 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMBOX1Q6NT76 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMBOX1Q6NT76 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMBOX1Q6NT76 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMBOX1Q6NT76 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMBOX1Q6NT76 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMBOX1Q6NT76 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMBOX1Q6NT76 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMBOX1Q6NT76 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMBOX1Q6NT76 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMBOX1Q6NT76 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMBOX1Q6NT76 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMBOX1Q6NT76 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMBOX1Q6NT76 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMBOX1Q6NT76 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMBOX1Q6NT76 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMBOX1Q6NT76 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HMBOX1Q6NT76 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMBOX1Q6NT76 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMBOX1Q6NT76 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMBOX1Q6NT76 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMBOX1Q6NT76 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMBOX1Q6NT76 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HMBOX1Q6NT76 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMBOX1Q6NT76 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMBOX1Q6NT76 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms