Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ22

RAB12, Ras-related protein Rab-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB12Q6IQ22 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB12Q6IQ22 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB12Q6IQ22 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB12Q6IQ22 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB12Q6IQ22 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB12Q6IQ22 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB12Q6IQ22 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB12Q6IQ22 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB12Q6IQ22 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB12Q6IQ22 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB12Q6IQ22 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB12Q6IQ22 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB12Q6IQ22 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB12Q6IQ22 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB12Q6IQ22 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB12Q6IQ22 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB12Q6IQ22 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB12Q6IQ22 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB12Q6IQ22 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB12Q6IQ22 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB12Q6IQ22 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB12Q6IQ22 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB12Q6IQ22 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB12Q6IQ22 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB12Q6IQ22 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RAB12Q6IQ22 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RAB12Q6IQ22 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB12Q6IQ22 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB12Q6IQ22 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB12Q6IQ22 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB12Q6IQ22 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB12Q6IQ22 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB12Q6IQ22 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB12Q6IQ22 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB12Q6IQ22 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB12Q6IQ22 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB12Q6IQ22 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB12Q6IQ22 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB12Q6IQ22 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB12Q6IQ22 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB12Q6IQ22 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB12Q6IQ22 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB12Q6IQ22 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB12Q6IQ22 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB12Q6IQ22 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB12Q6IQ22 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB12Q6IQ22 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB12Q6IQ22 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB12Q6IQ22 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB12Q6IQ22 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB12Q6IQ22 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB12Q6IQ22 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB12Q6IQ22 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB12Q6IQ22 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB12Q6IQ22 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB12Q6IQ22 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB12Q6IQ22 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB12Q6IQ22 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB12Q6IQ22 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB12Q6IQ22 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB12Q6IQ22 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB12Q6IQ22 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB12Q6IQ22 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB12Q6IQ22 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB12Q6IQ22 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB12Q6IQ22 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB12Q6IQ22 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB12Q6IQ22 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB12Q6IQ22 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB12Q6IQ22 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB12Q6IQ22 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB12Q6IQ22 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB12Q6IQ22 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB12Q6IQ22 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB12Q6IQ22 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB12Q6IQ22 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB12Q6IQ22 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB12Q6IQ22 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB12Q6IQ22 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB12Q6IQ22 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB12Q6IQ22 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB12Q6IQ22 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB12Q6IQ22 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB12Q6IQ22 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB12Q6IQ22 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB12Q6IQ22 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB12Q6IQ22 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB12Q6IQ22 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB12Q6IQ22 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB12Q6IQ22 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB12Q6IQ22 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB12Q6IQ22 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB12Q6IQ22 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB12Q6IQ22 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB12Q6IQ22 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB12Q6IQ22 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB12Q6IQ22 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB12Q6IQ22 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB12Q6IQ22 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB12Q6IQ22 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms