Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZW8

ZNF660, Zinc finger protein 660, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF660Q6AZW8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF660Q6AZW8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF660Q6AZW8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF660Q6AZW8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF660Q6AZW8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF660Q6AZW8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF660Q6AZW8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF660Q6AZW8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF660Q6AZW8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF660Q6AZW8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF660Q6AZW8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF660Q6AZW8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF660Q6AZW8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF660Q6AZW8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF660Q6AZW8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF660Q6AZW8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF660Q6AZW8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF660Q6AZW8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF660Q6AZW8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF660Q6AZW8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF660Q6AZW8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF660Q6AZW8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF660Q6AZW8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF660Q6AZW8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF660Q6AZW8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF660Q6AZW8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF660Q6AZW8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF660Q6AZW8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF660Q6AZW8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF660Q6AZW8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF660Q6AZW8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF660Q6AZW8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF660Q6AZW8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF660Q6AZW8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF660Q6AZW8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF660Q6AZW8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF660Q6AZW8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF660Q6AZW8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF660Q6AZW8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF660Q6AZW8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF660Q6AZW8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF660Q6AZW8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF660Q6AZW8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF660Q6AZW8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF660Q6AZW8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF660Q6AZW8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF660Q6AZW8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF660Q6AZW8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF660Q6AZW8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF660Q6AZW8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF660Q6AZW8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF660Q6AZW8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF660Q6AZW8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF660Q6AZW8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF660Q6AZW8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF660Q6AZW8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF660Q6AZW8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF660Q6AZW8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF660Q6AZW8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF660Q6AZW8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF660Q6AZW8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF660Q6AZW8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF660Q6AZW8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF660Q6AZW8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF660Q6AZW8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF660Q6AZW8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF660Q6AZW8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF660Q6AZW8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF660Q6AZW8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF660Q6AZW8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF660Q6AZW8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF660Q6AZW8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF660Q6AZW8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF660Q6AZW8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF660Q6AZW8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF660Q6AZW8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF660Q6AZW8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF660Q6AZW8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF660Q6AZW8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF660Q6AZW8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF660Q6AZW8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF660Q6AZW8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF660Q6AZW8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF660Q6AZW8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF660Q6AZW8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF660Q6AZW8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF660Q6AZW8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF660Q6AZW8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF660Q6AZW8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF660Q6AZW8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF660Q6AZW8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNF660Q6AZW8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF660Q6AZW8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF660Q6AZW8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF660Q6AZW8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF660Q6AZW8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF660Q6AZW8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF660Q6AZW8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF660Q6AZW8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF660Q6AZW8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms