Protein–RNA interactions for Protein: Q68D51

DENND2C, DENN domain-containing protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2CQ68D51 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DENND2CQ68D51 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DENND2CQ68D51 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DENND2CQ68D51 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DENND2CQ68D51 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DENND2CQ68D51 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DENND2CQ68D51 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
DENND2CQ68D51 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DENND2CQ68D51 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DENND2CQ68D51 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DENND2CQ68D51 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DENND2CQ68D51 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DENND2CQ68D51 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DENND2CQ68D51 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DENND2CQ68D51 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DENND2CQ68D51 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DENND2CQ68D51 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DENND2CQ68D51 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DENND2CQ68D51 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DENND2CQ68D51 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DENND2CQ68D51 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DENND2CQ68D51 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DENND2CQ68D51 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DENND2CQ68D51 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DENND2CQ68D51 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DENND2CQ68D51 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DENND2CQ68D51 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DENND2CQ68D51 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DENND2CQ68D51 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DENND2CQ68D51 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DENND2CQ68D51 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DENND2CQ68D51 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DENND2CQ68D51 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DENND2CQ68D51 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DENND2CQ68D51 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DENND2CQ68D51 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DENND2CQ68D51 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DENND2CQ68D51 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DENND2CQ68D51 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
DENND2CQ68D51 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DENND2CQ68D51 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DENND2CQ68D51 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DENND2CQ68D51 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DENND2CQ68D51 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DENND2CQ68D51 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DENND2CQ68D51 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DENND2CQ68D51 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DENND2CQ68D51 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DENND2CQ68D51 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DENND2CQ68D51 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DENND2CQ68D51 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DENND2CQ68D51 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DENND2CQ68D51 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DENND2CQ68D51 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DENND2CQ68D51 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DENND2CQ68D51 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DENND2CQ68D51 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DENND2CQ68D51 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DENND2CQ68D51 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DENND2CQ68D51 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DENND2CQ68D51 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DENND2CQ68D51 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DENND2CQ68D51 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DENND2CQ68D51 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DENND2CQ68D51 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DENND2CQ68D51 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DENND2CQ68D51 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DENND2CQ68D51 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DENND2CQ68D51 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DENND2CQ68D51 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DENND2CQ68D51 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DENND2CQ68D51 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DENND2CQ68D51 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DENND2CQ68D51 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DENND2CQ68D51 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DENND2CQ68D51 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DENND2CQ68D51 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DENND2CQ68D51 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DENND2CQ68D51 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DENND2CQ68D51 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms