Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
E4F1Q66K89 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
E4F1Q66K89 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
E4F1Q66K89 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
E4F1Q66K89 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
E4F1Q66K89 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
E4F1Q66K89 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
E4F1Q66K89 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
E4F1Q66K89 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
E4F1Q66K89 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
E4F1Q66K89 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
E4F1Q66K89 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
E4F1Q66K89 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
E4F1Q66K89 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
E4F1Q66K89 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
E4F1Q66K89 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
E4F1Q66K89 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
E4F1Q66K89 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
E4F1Q66K89 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
E4F1Q66K89 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
E4F1Q66K89 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
E4F1Q66K89 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
E4F1Q66K89 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
E4F1Q66K89 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
E4F1Q66K89 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
E4F1Q66K89 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
E4F1Q66K89 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
E4F1Q66K89 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
E4F1Q66K89 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
E4F1Q66K89 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
E4F1Q66K89 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
E4F1Q66K89 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
E4F1Q66K89 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
E4F1Q66K89 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
E4F1Q66K89 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
E4F1Q66K89 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
E4F1Q66K89 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
E4F1Q66K89 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
E4F1Q66K89 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
E4F1Q66K89 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
E4F1Q66K89 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
E4F1Q66K89 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
E4F1Q66K89 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
E4F1Q66K89 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
E4F1Q66K89 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
E4F1Q66K89 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
E4F1Q66K89 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
E4F1Q66K89 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
E4F1Q66K89 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
E4F1Q66K89 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
E4F1Q66K89 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
E4F1Q66K89 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
E4F1Q66K89 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
E4F1Q66K89 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
E4F1Q66K89 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
E4F1Q66K89 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
E4F1Q66K89 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
E4F1Q66K89 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
E4F1Q66K89 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
E4F1Q66K89 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
E4F1Q66K89 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
E4F1Q66K89 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
E4F1Q66K89 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
E4F1Q66K89 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
E4F1Q66K89 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
E4F1Q66K89 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
E4F1Q66K89 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
E4F1Q66K89 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
E4F1Q66K89 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
E4F1Q66K89 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
E4F1Q66K89 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
E4F1Q66K89 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
E4F1Q66K89 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
E4F1Q66K89 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
E4F1Q66K89 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
E4F1Q66K89 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
E4F1Q66K89 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
E4F1Q66K89 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
E4F1Q66K89 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
E4F1Q66K89 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
E4F1Q66K89 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
E4F1Q66K89 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
E4F1Q66K89 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
E4F1Q66K89 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
E4F1Q66K89 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
E4F1Q66K89 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
E4F1Q66K89 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
E4F1Q66K89 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
E4F1Q66K89 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
E4F1Q66K89 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
E4F1Q66K89 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
E4F1Q66K89 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
E4F1Q66K89 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
E4F1Q66K89 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
E4F1Q66K89 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
E4F1Q66K89 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
E4F1Q66K89 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
E4F1Q66K89 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
E4F1Q66K89 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
E4F1Q66K89 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms