Protein–RNA interactions for Protein: Q63HQ0

AP1AR, AP-1 complex-associated regulatory protein, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1ARQ63HQ0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
AP1ARQ63HQ0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AP1ARQ63HQ0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AP1ARQ63HQ0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP1ARQ63HQ0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP1ARQ63HQ0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP1ARQ63HQ0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP1ARQ63HQ0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP1ARQ63HQ0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP1ARQ63HQ0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AP1ARQ63HQ0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AP1ARQ63HQ0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AP1ARQ63HQ0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AP1ARQ63HQ0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
AP1ARQ63HQ0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
AP1ARQ63HQ0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP1ARQ63HQ0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP1ARQ63HQ0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP1ARQ63HQ0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP1ARQ63HQ0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP1ARQ63HQ0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP1ARQ63HQ0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP1ARQ63HQ0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP1ARQ63HQ0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AP1ARQ63HQ0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP1ARQ63HQ0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP1ARQ63HQ0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP1ARQ63HQ0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
AP1ARQ63HQ0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP1ARQ63HQ0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP1ARQ63HQ0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP1ARQ63HQ0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP1ARQ63HQ0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AP1ARQ63HQ0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AP1ARQ63HQ0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP1ARQ63HQ0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP1ARQ63HQ0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
AP1ARQ63HQ0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP1ARQ63HQ0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
AP1ARQ63HQ0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP1ARQ63HQ0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP1ARQ63HQ0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP1ARQ63HQ0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP1ARQ63HQ0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP1ARQ63HQ0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AP1ARQ63HQ0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP1ARQ63HQ0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP1ARQ63HQ0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP1ARQ63HQ0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP1ARQ63HQ0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP1ARQ63HQ0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP1ARQ63HQ0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP1ARQ63HQ0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP1ARQ63HQ0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP1ARQ63HQ0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP1ARQ63HQ0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP1ARQ63HQ0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP1ARQ63HQ0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP1ARQ63HQ0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP1ARQ63HQ0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP1ARQ63HQ0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
AP1ARQ63HQ0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP1ARQ63HQ0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP1ARQ63HQ0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP1ARQ63HQ0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP1ARQ63HQ0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP1ARQ63HQ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP1ARQ63HQ0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP1ARQ63HQ0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP1ARQ63HQ0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP1ARQ63HQ0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP1ARQ63HQ0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP1ARQ63HQ0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP1ARQ63HQ0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP1ARQ63HQ0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP1ARQ63HQ0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP1ARQ63HQ0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP1ARQ63HQ0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP1ARQ63HQ0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP1ARQ63HQ0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP1ARQ63HQ0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP1ARQ63HQ0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP1ARQ63HQ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP1ARQ63HQ0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP1ARQ63HQ0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP1ARQ63HQ0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP1ARQ63HQ0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP1ARQ63HQ0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP1ARQ63HQ0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP1ARQ63HQ0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP1ARQ63HQ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP1ARQ63HQ0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP1ARQ63HQ0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP1ARQ63HQ0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP1ARQ63HQ0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP1ARQ63HQ0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP1ARQ63HQ0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP1ARQ63HQ0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP1ARQ63HQ0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
AP1ARQ63HQ0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms