Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SPATA1Q5VX52 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SPATA1Q5VX52 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SPATA1Q5VX52 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SPATA1Q5VX52 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SPATA1Q5VX52 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SPATA1Q5VX52 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SPATA1Q5VX52 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SPATA1Q5VX52 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SPATA1Q5VX52 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SPATA1Q5VX52 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SPATA1Q5VX52 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SPATA1Q5VX52 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SPATA1Q5VX52 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SPATA1Q5VX52 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SPATA1Q5VX52 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SPATA1Q5VX52 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SPATA1Q5VX52 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SPATA1Q5VX52 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SPATA1Q5VX52 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SPATA1Q5VX52 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SPATA1Q5VX52 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SPATA1Q5VX52 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SPATA1Q5VX52 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SPATA1Q5VX52 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SPATA1Q5VX52 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SPATA1Q5VX52 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SPATA1Q5VX52 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SPATA1Q5VX52 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SPATA1Q5VX52 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SPATA1Q5VX52 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SPATA1Q5VX52 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SPATA1Q5VX52 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SPATA1Q5VX52 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SPATA1Q5VX52 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SPATA1Q5VX52 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SPATA1Q5VX52 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SPATA1Q5VX52 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPATA1Q5VX52 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPATA1Q5VX52 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPATA1Q5VX52 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SPATA1Q5VX52 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SPATA1Q5VX52 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPATA1Q5VX52 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPATA1Q5VX52 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPATA1Q5VX52 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SPATA1Q5VX52 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPATA1Q5VX52 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPATA1Q5VX52 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPATA1Q5VX52 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPATA1Q5VX52 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SPATA1Q5VX52 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPATA1Q5VX52 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPATA1Q5VX52 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SPATA1Q5VX52 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPATA1Q5VX52 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPATA1Q5VX52 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SPATA1Q5VX52 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPATA1Q5VX52 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPATA1Q5VX52 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SPATA1Q5VX52 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SPATA1Q5VX52 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPATA1Q5VX52 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPATA1Q5VX52 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPATA1Q5VX52 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPATA1Q5VX52 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPATA1Q5VX52 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPATA1Q5VX52 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SPATA1Q5VX52 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SPATA1Q5VX52 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SPATA1Q5VX52 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SPATA1Q5VX52 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SPATA1Q5VX52 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SPATA1Q5VX52 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SPATA1Q5VX52 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SPATA1Q5VX52 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SPATA1Q5VX52 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SPATA1Q5VX52 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SPATA1Q5VX52 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SPATA1Q5VX52 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SPATA1Q5VX52 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SPATA1Q5VX52 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPATA1Q5VX52 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPATA1Q5VX52 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPATA1Q5VX52 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPATA1Q5VX52 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SPATA1Q5VX52 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SPATA1Q5VX52 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPATA1Q5VX52 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPATA1Q5VX52 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPATA1Q5VX52 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SPATA1Q5VX52 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SPATA1Q5VX52 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SPATA1Q5VX52 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SPATA1Q5VX52 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SPATA1Q5VX52 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPATA1Q5VX52 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPATA1Q5VX52 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPATA1Q5VX52 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SPATA1Q5VX52 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms