Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT25

CDC42BPA, Serine/threonine-protein kinase MRCK alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42BPAQ5VT25 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CDC42BPAQ5VT25 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CDC42BPAQ5VT25 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC42.28■■■■■ 4.36
CDC42BPAQ5VT25 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CDC42BPAQ5VT25 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CDC42BPAQ5VT25 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CDC42BPAQ5VT25 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
CDC42BPAQ5VT25 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
CDC42BPAQ5VT25 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
CDC42BPAQ5VT25 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
CDC42BPAQ5VT25 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
CDC42BPAQ5VT25 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CDC42BPAQ5VT25 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
CDC42BPAQ5VT25 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
CDC42BPAQ5VT25 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC42.16■■■■■ 4.34
CDC42BPAQ5VT25 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC42.16■■■■■ 4.34
CDC42BPAQ5VT25 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
CDC42BPAQ5VT25 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC42.14■■■■■ 4.34
CDC42BPAQ5VT25 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CDC42BPAQ5VT25 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
CDC42BPAQ5VT25 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC42.11■■■■■ 4.33
CDC42BPAQ5VT25 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
CDC42BPAQ5VT25 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
CDC42BPAQ5VT25 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
CDC42BPAQ5VT25 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
CDC42BPAQ5VT25 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
CDC42BPAQ5VT25 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
CDC42BPAQ5VT25 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
CDC42BPAQ5VT25 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CDC42BPAQ5VT25 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
CDC42BPAQ5VT25 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
CDC42BPAQ5VT25 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CDC42BPAQ5VT25 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CDC42BPAQ5VT25 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
CDC42BPAQ5VT25 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
CDC42BPAQ5VT25 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CDC42BPAQ5VT25 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
CDC42BPAQ5VT25 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
CDC42BPAQ5VT25 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CDC42BPAQ5VT25 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CDC42BPAQ5VT25 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
CDC42BPAQ5VT25 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
CDC42BPAQ5VT25 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
CDC42BPAQ5VT25 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CDC42BPAQ5VT25 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
CDC42BPAQ5VT25 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
CDC42BPAQ5VT25 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
CDC42BPAQ5VT25 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
CDC42BPAQ5VT25 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
CDC42BPAQ5VT25 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
CDC42BPAQ5VT25 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
CDC42BPAQ5VT25 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
CDC42BPAQ5VT25 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
CDC42BPAQ5VT25 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CDC42BPAQ5VT25 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CDC42BPAQ5VT25 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
CDC42BPAQ5VT25 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CDC42BPAQ5VT25 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
CDC42BPAQ5VT25 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
CDC42BPAQ5VT25 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
CDC42BPAQ5VT25 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.78■■■■■ 4.28
CDC42BPAQ5VT25 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
CDC42BPAQ5VT25 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CDC42BPAQ5VT25 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
CDC42BPAQ5VT25 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
CDC42BPAQ5VT25 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
CDC42BPAQ5VT25 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
CDC42BPAQ5VT25 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
CDC42BPAQ5VT25 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
CDC42BPAQ5VT25 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
CDC42BPAQ5VT25 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
CDC42BPAQ5VT25 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
CDC42BPAQ5VT25 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC41.69■■■■■ 4.26
CDC42BPAQ5VT25 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
CDC42BPAQ5VT25 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
CDC42BPAQ5VT25 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
CDC42BPAQ5VT25 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
CDC42BPAQ5VT25 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
CDC42BPAQ5VT25 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CDC42BPAQ5VT25 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
CDC42BPAQ5VT25 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
CDC42BPAQ5VT25 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
CDC42BPAQ5VT25 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
CDC42BPAQ5VT25 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CDC42BPAQ5VT25 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CDC42BPAQ5VT25 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
CDC42BPAQ5VT25 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
CDC42BPAQ5VT25 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
CDC42BPAQ5VT25 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
CDC42BPAQ5VT25 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC41.55■■■■■ 4.24
CDC42BPAQ5VT25 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CDC42BPAQ5VT25 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
CDC42BPAQ5VT25 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
CDC42BPAQ5VT25 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
CDC42BPAQ5VT25 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
CDC42BPAQ5VT25 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
CDC42BPAQ5VT25 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
CDC42BPAQ5VT25 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CDC42BPAQ5VT25 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
CDC42BPAQ5VT25 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms