Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC181Q5TID7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC181Q5TID7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC181Q5TID7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC181Q5TID7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC181Q5TID7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC181Q5TID7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC181Q5TID7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC181Q5TID7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC181Q5TID7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC181Q5TID7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC181Q5TID7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC181Q5TID7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC181Q5TID7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC181Q5TID7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC181Q5TID7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC181Q5TID7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC181Q5TID7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC181Q5TID7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC181Q5TID7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC181Q5TID7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC181Q5TID7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC181Q5TID7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC181Q5TID7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC181Q5TID7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC181Q5TID7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC181Q5TID7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC181Q5TID7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC181Q5TID7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC181Q5TID7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC181Q5TID7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC181Q5TID7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC181Q5TID7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC181Q5TID7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC181Q5TID7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC181Q5TID7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC181Q5TID7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC181Q5TID7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC181Q5TID7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC181Q5TID7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC181Q5TID7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC181Q5TID7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC181Q5TID7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC181Q5TID7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC181Q5TID7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC181Q5TID7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC181Q5TID7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC181Q5TID7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC181Q5TID7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC181Q5TID7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC181Q5TID7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC181Q5TID7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC181Q5TID7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC181Q5TID7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC181Q5TID7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC181Q5TID7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC181Q5TID7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC181Q5TID7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC181Q5TID7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC181Q5TID7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC181Q5TID7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC181Q5TID7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC181Q5TID7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC181Q5TID7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC181Q5TID7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC181Q5TID7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC181Q5TID7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC181Q5TID7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC181Q5TID7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC181Q5TID7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC181Q5TID7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC181Q5TID7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC181Q5TID7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC181Q5TID7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC181Q5TID7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC181Q5TID7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC181Q5TID7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC181Q5TID7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC181Q5TID7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC181Q5TID7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC181Q5TID7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC181Q5TID7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC181Q5TID7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC181Q5TID7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC181Q5TID7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC181Q5TID7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC181Q5TID7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC181Q5TID7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC181Q5TID7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC181Q5TID7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC181Q5TID7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC181Q5TID7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC181Q5TID7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC181Q5TID7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC181Q5TID7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC181Q5TID7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC181Q5TID7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC181Q5TID7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC181Q5TID7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC181Q5TID7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms