Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ68

SPDYC, Speedy protein C, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYCQ5MJ68 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPDYCQ5MJ68 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPDYCQ5MJ68 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPDYCQ5MJ68 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPDYCQ5MJ68 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPDYCQ5MJ68 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPDYCQ5MJ68 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPDYCQ5MJ68 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPDYCQ5MJ68 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPDYCQ5MJ68 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPDYCQ5MJ68 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPDYCQ5MJ68 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPDYCQ5MJ68 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPDYCQ5MJ68 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPDYCQ5MJ68 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPDYCQ5MJ68 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPDYCQ5MJ68 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPDYCQ5MJ68 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPDYCQ5MJ68 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPDYCQ5MJ68 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPDYCQ5MJ68 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPDYCQ5MJ68 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPDYCQ5MJ68 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SPDYCQ5MJ68 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SPDYCQ5MJ68 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPDYCQ5MJ68 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPDYCQ5MJ68 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPDYCQ5MJ68 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPDYCQ5MJ68 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPDYCQ5MJ68 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPDYCQ5MJ68 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPDYCQ5MJ68 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPDYCQ5MJ68 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SPDYCQ5MJ68 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPDYCQ5MJ68 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPDYCQ5MJ68 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPDYCQ5MJ68 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPDYCQ5MJ68 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPDYCQ5MJ68 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPDYCQ5MJ68 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPDYCQ5MJ68 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPDYCQ5MJ68 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPDYCQ5MJ68 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPDYCQ5MJ68 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPDYCQ5MJ68 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPDYCQ5MJ68 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPDYCQ5MJ68 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPDYCQ5MJ68 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SPDYCQ5MJ68 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SPDYCQ5MJ68 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPDYCQ5MJ68 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPDYCQ5MJ68 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPDYCQ5MJ68 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPDYCQ5MJ68 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SPDYCQ5MJ68 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPDYCQ5MJ68 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPDYCQ5MJ68 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPDYCQ5MJ68 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPDYCQ5MJ68 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPDYCQ5MJ68 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPDYCQ5MJ68 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPDYCQ5MJ68 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPDYCQ5MJ68 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SPDYCQ5MJ68 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPDYCQ5MJ68 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPDYCQ5MJ68 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPDYCQ5MJ68 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPDYCQ5MJ68 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPDYCQ5MJ68 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPDYCQ5MJ68 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPDYCQ5MJ68 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPDYCQ5MJ68 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPDYCQ5MJ68 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPDYCQ5MJ68 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPDYCQ5MJ68 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPDYCQ5MJ68 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPDYCQ5MJ68 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SPDYCQ5MJ68 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPDYCQ5MJ68 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPDYCQ5MJ68 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPDYCQ5MJ68 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPDYCQ5MJ68 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPDYCQ5MJ68 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPDYCQ5MJ68 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPDYCQ5MJ68 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPDYCQ5MJ68 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPDYCQ5MJ68 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SPDYCQ5MJ68 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPDYCQ5MJ68 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPDYCQ5MJ68 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPDYCQ5MJ68 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPDYCQ5MJ68 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPDYCQ5MJ68 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPDYCQ5MJ68 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPDYCQ5MJ68 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SPDYCQ5MJ68 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPDYCQ5MJ68 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPDYCQ5MJ68 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPDYCQ5MJ68 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPDYCQ5MJ68 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms