Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
SAMD9Q5K651 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
SAMD9Q5K651 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.95■■■■■ 4.63
SAMD9Q5K651 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.95■■■■■ 4.63
SAMD9Q5K651 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.93■■■■■ 4.62
SAMD9Q5K651 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
SAMD9Q5K651 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
SAMD9Q5K651 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
SAMD9Q5K651 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC43.9■■■■■ 4.62
SAMD9Q5K651 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC43.89■■■■■ 4.62
SAMD9Q5K651 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC43.87■■■■■ 4.61
SAMD9Q5K651 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
SAMD9Q5K651 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
SAMD9Q5K651 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
SAMD9Q5K651 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
SAMD9Q5K651 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
SAMD9Q5K651 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
SAMD9Q5K651 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
SAMD9Q5K651 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
SAMD9Q5K651 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC43.8■■■■■ 4.6
SAMD9Q5K651 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
SAMD9Q5K651 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
SAMD9Q5K651 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
SAMD9Q5K651 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
SAMD9Q5K651 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC43.75■■■■■ 4.59
SAMD9Q5K651 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC43.74■■■■■ 4.59
SAMD9Q5K651 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC43.74■■■■■ 4.59
SAMD9Q5K651 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
SAMD9Q5K651 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
SAMD9Q5K651 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC43.69■■■■■ 4.58
SAMD9Q5K651 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
SAMD9Q5K651 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
SAMD9Q5K651 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
SAMD9Q5K651 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
SAMD9Q5K651 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
SAMD9Q5K651 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC43.67■■■■■ 4.58
SAMD9Q5K651 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.67■■■■■ 4.58
SAMD9Q5K651 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
SAMD9Q5K651 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
SAMD9Q5K651 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
SAMD9Q5K651 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
SAMD9Q5K651 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC43.64■■■■■ 4.58
SAMD9Q5K651 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC43.63■■■■■ 4.58
SAMD9Q5K651 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
SAMD9Q5K651 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
SAMD9Q5K651 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
SAMD9Q5K651 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
SAMD9Q5K651 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
SAMD9Q5K651 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
SAMD9Q5K651 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
SAMD9Q5K651 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC43.54■■■■■ 4.56
SAMD9Q5K651 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.56
SAMD9Q5K651 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
SAMD9Q5K651 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC43.5■■■■■ 4.55
SAMD9Q5K651 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
SAMD9Q5K651 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
SAMD9Q5K651 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
SAMD9Q5K651 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
SAMD9Q5K651 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
SAMD9Q5K651 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
SAMD9Q5K651 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
SAMD9Q5K651 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
SAMD9Q5K651 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
SAMD9Q5K651 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
SAMD9Q5K651 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
SAMD9Q5K651 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC43.45■■■■■ 4.55
SAMD9Q5K651 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
SAMD9Q5K651 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
SAMD9Q5K651 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
SAMD9Q5K651 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
SAMD9Q5K651 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
SAMD9Q5K651 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
SAMD9Q5K651 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
SAMD9Q5K651 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
SAMD9Q5K651 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
SAMD9Q5K651 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
SAMD9Q5K651 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
SAMD9Q5K651 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
SAMD9Q5K651 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.52
SAMD9Q5K651 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
SAMD9Q5K651 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
SAMD9Q5K651 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
SAMD9Q5K651 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC43.29■■■■■ 4.52
SAMD9Q5K651 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC43.29■■■■■ 4.52
SAMD9Q5K651 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
SAMD9Q5K651 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
SAMD9Q5K651 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
SAMD9Q5K651 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
SAMD9Q5K651 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
SAMD9Q5K651 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
SAMD9Q5K651 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
SAMD9Q5K651 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
SAMD9Q5K651 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
SAMD9Q5K651 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
SAMD9Q5K651 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
SAMD9Q5K651 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
SAMD9Q5K651 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
SAMD9Q5K651 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
SAMD9Q5K651 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
SAMD9Q5K651 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms