Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GREB1Q4ZG55 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GREB1Q4ZG55 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GREB1Q4ZG55 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GREB1Q4ZG55 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GREB1Q4ZG55 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GREB1Q4ZG55 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GREB1Q4ZG55 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GREB1Q4ZG55 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GREB1Q4ZG55 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GREB1Q4ZG55 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GREB1Q4ZG55 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GREB1Q4ZG55 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GREB1Q4ZG55 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GREB1Q4ZG55 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GREB1Q4ZG55 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GREB1Q4ZG55 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GREB1Q4ZG55 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GREB1Q4ZG55 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GREB1Q4ZG55 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GREB1Q4ZG55 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GREB1Q4ZG55 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GREB1Q4ZG55 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GREB1Q4ZG55 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
GREB1Q4ZG55 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GREB1Q4ZG55 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GREB1Q4ZG55 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GREB1Q4ZG55 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GREB1Q4ZG55 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GREB1Q4ZG55 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GREB1Q4ZG55 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GREB1Q4ZG55 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GREB1Q4ZG55 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GREB1Q4ZG55 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GREB1Q4ZG55 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GREB1Q4ZG55 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GREB1Q4ZG55 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GREB1Q4ZG55 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GREB1Q4ZG55 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GREB1Q4ZG55 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GREB1Q4ZG55 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GREB1Q4ZG55 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GREB1Q4ZG55 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GREB1Q4ZG55 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GREB1Q4ZG55 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GREB1Q4ZG55 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GREB1Q4ZG55 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GREB1Q4ZG55 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GREB1Q4ZG55 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GREB1Q4ZG55 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GREB1Q4ZG55 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GREB1Q4ZG55 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GREB1Q4ZG55 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GREB1Q4ZG55 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GREB1Q4ZG55 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GREB1Q4ZG55 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GREB1Q4ZG55 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GREB1Q4ZG55 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GREB1Q4ZG55 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GREB1Q4ZG55 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GREB1Q4ZG55 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GREB1Q4ZG55 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GREB1Q4ZG55 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GREB1Q4ZG55 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GREB1Q4ZG55 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GREB1Q4ZG55 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GREB1Q4ZG55 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GREB1Q4ZG55 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GREB1Q4ZG55 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GREB1Q4ZG55 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GREB1Q4ZG55 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GREB1Q4ZG55 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
GREB1Q4ZG55 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GREB1Q4ZG55 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GREB1Q4ZG55 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GREB1Q4ZG55 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GREB1Q4ZG55 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GREB1Q4ZG55 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GREB1Q4ZG55 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GREB1Q4ZG55 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GREB1Q4ZG55 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GREB1Q4ZG55 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GREB1Q4ZG55 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GREB1Q4ZG55 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GREB1Q4ZG55 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GREB1Q4ZG55 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GREB1Q4ZG55 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GREB1Q4ZG55 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GREB1Q4ZG55 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GREB1Q4ZG55 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GREB1Q4ZG55 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GREB1Q4ZG55 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GREB1Q4ZG55 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GREB1Q4ZG55 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GREB1Q4ZG55 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GREB1Q4ZG55 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GREB1Q4ZG55 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GREB1Q4ZG55 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GREB1Q4ZG55 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GREB1Q4ZG55 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms