Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL9Q3SXZ7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL9Q3SXZ7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TTLL9Q3SXZ7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTLL9Q3SXZ7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TTLL9Q3SXZ7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL9Q3SXZ7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL9Q3SXZ7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTLL9Q3SXZ7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL9Q3SXZ7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL9Q3SXZ7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTLL9Q3SXZ7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TTLL9Q3SXZ7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTLL9Q3SXZ7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TTLL9Q3SXZ7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTLL9Q3SXZ7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTLL9Q3SXZ7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL9Q3SXZ7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL9Q3SXZ7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL9Q3SXZ7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL9Q3SXZ7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL9Q3SXZ7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL9Q3SXZ7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL9Q3SXZ7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL9Q3SXZ7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTLL9Q3SXZ7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTLL9Q3SXZ7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTLL9Q3SXZ7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL9Q3SXZ7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL9Q3SXZ7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL9Q3SXZ7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL9Q3SXZ7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTLL9Q3SXZ7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTLL9Q3SXZ7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTLL9Q3SXZ7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTLL9Q3SXZ7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTLL9Q3SXZ7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTLL9Q3SXZ7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTLL9Q3SXZ7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTLL9Q3SXZ7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTLL9Q3SXZ7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTLL9Q3SXZ7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTLL9Q3SXZ7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTLL9Q3SXZ7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTLL9Q3SXZ7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTLL9Q3SXZ7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTLL9Q3SXZ7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TTLL9Q3SXZ7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTLL9Q3SXZ7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTLL9Q3SXZ7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTLL9Q3SXZ7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTLL9Q3SXZ7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTLL9Q3SXZ7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTLL9Q3SXZ7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTLL9Q3SXZ7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTLL9Q3SXZ7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTLL9Q3SXZ7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTLL9Q3SXZ7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTLL9Q3SXZ7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TTLL9Q3SXZ7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTLL9Q3SXZ7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTLL9Q3SXZ7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTLL9Q3SXZ7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTLL9Q3SXZ7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTLL9Q3SXZ7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTLL9Q3SXZ7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTLL9Q3SXZ7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTLL9Q3SXZ7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTLL9Q3SXZ7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTLL9Q3SXZ7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTLL9Q3SXZ7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTLL9Q3SXZ7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTLL9Q3SXZ7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TTLL9Q3SXZ7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTLL9Q3SXZ7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTLL9Q3SXZ7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTLL9Q3SXZ7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL9Q3SXZ7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL9Q3SXZ7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL9Q3SXZ7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL9Q3SXZ7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL9Q3SXZ7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL9Q3SXZ7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL9Q3SXZ7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL9Q3SXZ7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL9Q3SXZ7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL9Q3SXZ7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL9Q3SXZ7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL9Q3SXZ7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL9Q3SXZ7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL9Q3SXZ7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL9Q3SXZ7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL9Q3SXZ7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL9Q3SXZ7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL9Q3SXZ7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL9Q3SXZ7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL9Q3SXZ7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL9Q3SXZ7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms