Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRTAP24-1Q3LI83 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRTAP24-1Q3LI83 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRTAP24-1Q3LI83 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRTAP24-1Q3LI83 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRTAP24-1Q3LI83 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRTAP24-1Q3LI83 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRTAP24-1Q3LI83 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRTAP24-1Q3LI83 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRTAP24-1Q3LI83 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRTAP24-1Q3LI83 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRTAP24-1Q3LI83 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRTAP24-1Q3LI83 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRTAP24-1Q3LI83 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRTAP24-1Q3LI83 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRTAP24-1Q3LI83 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRTAP24-1Q3LI83 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRTAP24-1Q3LI83 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRTAP24-1Q3LI83 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP24-1Q3LI83 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KRTAP24-1Q3LI83 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP24-1Q3LI83 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP24-1Q3LI83 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP24-1Q3LI83 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP24-1Q3LI83 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP24-1Q3LI83 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRTAP24-1Q3LI83 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRTAP24-1Q3LI83 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRTAP24-1Q3LI83 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRTAP24-1Q3LI83 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRTAP24-1Q3LI83 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRTAP24-1Q3LI83 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRTAP24-1Q3LI83 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRTAP24-1Q3LI83 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRTAP24-1Q3LI83 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KRTAP24-1Q3LI83 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRTAP24-1Q3LI83 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRTAP24-1Q3LI83 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRTAP24-1Q3LI83 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRTAP24-1Q3LI83 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRTAP24-1Q3LI83 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRTAP24-1Q3LI83 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRTAP24-1Q3LI83 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRTAP24-1Q3LI83 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRTAP24-1Q3LI83 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRTAP24-1Q3LI83 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRTAP24-1Q3LI83 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRTAP24-1Q3LI83 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRTAP24-1Q3LI83 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRTAP24-1Q3LI83 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRTAP24-1Q3LI83 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KRTAP24-1Q3LI83 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRTAP24-1Q3LI83 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRTAP24-1Q3LI83 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KRTAP24-1Q3LI83 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRTAP24-1Q3LI83 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRTAP24-1Q3LI83 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRTAP24-1Q3LI83 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRTAP24-1Q3LI83 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRTAP24-1Q3LI83 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRTAP24-1Q3LI83 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRTAP24-1Q3LI83 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRTAP24-1Q3LI83 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KRTAP24-1Q3LI83 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KRTAP24-1Q3LI83 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KRTAP24-1Q3LI83 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRTAP24-1Q3LI83 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRTAP24-1Q3LI83 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRTAP24-1Q3LI83 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRTAP24-1Q3LI83 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRTAP24-1Q3LI83 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRTAP24-1Q3LI83 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRTAP24-1Q3LI83 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRTAP24-1Q3LI83 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRTAP24-1Q3LI83 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRTAP24-1Q3LI83 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRTAP24-1Q3LI83 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRTAP24-1Q3LI83 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRTAP24-1Q3LI83 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRTAP24-1Q3LI83 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRTAP24-1Q3LI83 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRTAP24-1Q3LI83 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRTAP24-1Q3LI83 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRTAP24-1Q3LI83 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KRTAP24-1Q3LI83 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRTAP24-1Q3LI83 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRTAP24-1Q3LI83 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRTAP24-1Q3LI83 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRTAP24-1Q3LI83 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRTAP24-1Q3LI83 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRTAP24-1Q3LI83 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRTAP24-1Q3LI83 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRTAP24-1Q3LI83 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRTAP24-1Q3LI83 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KRTAP24-1Q3LI83 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRTAP24-1Q3LI83 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRTAP24-1Q3LI83 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRTAP24-1Q3LI83 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KRTAP24-1Q3LI83 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms