Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TSR1Q2NL82 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TSR1Q2NL82 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TSR1Q2NL82 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TSR1Q2NL82 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TSR1Q2NL82 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TSR1Q2NL82 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TSR1Q2NL82 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TSR1Q2NL82 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TSR1Q2NL82 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TSR1Q2NL82 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TSR1Q2NL82 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TSR1Q2NL82 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TSR1Q2NL82 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TSR1Q2NL82 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TSR1Q2NL82 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TSR1Q2NL82 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TSR1Q2NL82 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSR1Q2NL82 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSR1Q2NL82 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TSR1Q2NL82 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TSR1Q2NL82 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TSR1Q2NL82 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TSR1Q2NL82 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TSR1Q2NL82 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TSR1Q2NL82 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSR1Q2NL82 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSR1Q2NL82 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSR1Q2NL82 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSR1Q2NL82 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSR1Q2NL82 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TSR1Q2NL82 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TSR1Q2NL82 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TSR1Q2NL82 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSR1Q2NL82 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSR1Q2NL82 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSR1Q2NL82 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSR1Q2NL82 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TSR1Q2NL82 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TSR1Q2NL82 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TSR1Q2NL82 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TSR1Q2NL82 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TSR1Q2NL82 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TSR1Q2NL82 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TSR1Q2NL82 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TSR1Q2NL82 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TSR1Q2NL82 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TSR1Q2NL82 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TSR1Q2NL82 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TSR1Q2NL82 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TSR1Q2NL82 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TSR1Q2NL82 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TSR1Q2NL82 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TSR1Q2NL82 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TSR1Q2NL82 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TSR1Q2NL82 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TSR1Q2NL82 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TSR1Q2NL82 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TSR1Q2NL82 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TSR1Q2NL82 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TSR1Q2NL82 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TSR1Q2NL82 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TSR1Q2NL82 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TSR1Q2NL82 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TSR1Q2NL82 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TSR1Q2NL82 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TSR1Q2NL82 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TSR1Q2NL82 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TSR1Q2NL82 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TSR1Q2NL82 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TSR1Q2NL82 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TSR1Q2NL82 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TSR1Q2NL82 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TSR1Q2NL82 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TSR1Q2NL82 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TSR1Q2NL82 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TSR1Q2NL82 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TSR1Q2NL82 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TSR1Q2NL82 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TSR1Q2NL82 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TSR1Q2NL82 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TSR1Q2NL82 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TSR1Q2NL82 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TSR1Q2NL82 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TSR1Q2NL82 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TSR1Q2NL82 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TSR1Q2NL82 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TSR1Q2NL82 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TSR1Q2NL82 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TSR1Q2NL82 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TSR1Q2NL82 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TSR1Q2NL82 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TSR1Q2NL82 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TSR1Q2NL82 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TSR1Q2NL82 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TSR1Q2NL82 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TSR1Q2NL82 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TSR1Q2NL82 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TSR1Q2NL82 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TSR1Q2NL82 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms