Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MICBQ29980 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MICBQ29980 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MICBQ29980 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MICBQ29980 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
MICBQ29980 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MICBQ29980 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MICBQ29980 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MICBQ29980 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MICBQ29980 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MICBQ29980 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MICBQ29980 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MICBQ29980 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MICBQ29980 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MICBQ29980 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MICBQ29980 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MICBQ29980 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MICBQ29980 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MICBQ29980 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MICBQ29980 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MICBQ29980 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MICBQ29980 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MICBQ29980 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MICBQ29980 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MICBQ29980 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MICBQ29980 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MICBQ29980 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MICBQ29980 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MICBQ29980 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MICBQ29980 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MICBQ29980 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MICBQ29980 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MICBQ29980 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MICBQ29980 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MICBQ29980 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MICBQ29980 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MICBQ29980 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MICBQ29980 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MICBQ29980 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MICBQ29980 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MICBQ29980 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MICBQ29980 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MICBQ29980 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MICBQ29980 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MICBQ29980 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MICBQ29980 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MICBQ29980 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MICBQ29980 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MICBQ29980 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MICBQ29980 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MICBQ29980 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MICBQ29980 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MICBQ29980 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MICBQ29980 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MICBQ29980 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MICBQ29980 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MICBQ29980 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MICBQ29980 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MICBQ29980 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MICBQ29980 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MICBQ29980 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MICBQ29980 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MICBQ29980 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MICBQ29980 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MICBQ29980 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MICBQ29980 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MICBQ29980 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MICBQ29980 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MICBQ29980 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MICBQ29980 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MICBQ29980 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MICBQ29980 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MICBQ29980 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MICBQ29980 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MICBQ29980 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MICBQ29980 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MICBQ29980 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MICBQ29980 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MICBQ29980 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MICBQ29980 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MICBQ29980 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MICBQ29980 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MICBQ29980 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MICBQ29980 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MICBQ29980 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MICBQ29980 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MICBQ29980 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MICBQ29980 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MICBQ29980 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MICBQ29980 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MICBQ29980 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MICBQ29980 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MICBQ29980 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MICBQ29980 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MICBQ29980 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MICBQ29980 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MICBQ29980 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MICBQ29980 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MICBQ29980 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MICBQ29980 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms