Protein–RNA interactions for Protein: Q1AE95

TMEM183B, Transmembrane protein 183B, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM183BQ1AE95 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM183BQ1AE95 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM183BQ1AE95 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM183BQ1AE95 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM183BQ1AE95 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM183BQ1AE95 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM183BQ1AE95 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM183BQ1AE95 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM183BQ1AE95 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM183BQ1AE95 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM183BQ1AE95 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM183BQ1AE95 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM183BQ1AE95 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM183BQ1AE95 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM183BQ1AE95 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM183BQ1AE95 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM183BQ1AE95 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM183BQ1AE95 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM183BQ1AE95 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMEM183BQ1AE95 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMEM183BQ1AE95 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM183BQ1AE95 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM183BQ1AE95 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM183BQ1AE95 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM183BQ1AE95 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM183BQ1AE95 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM183BQ1AE95 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM183BQ1AE95 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM183BQ1AE95 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM183BQ1AE95 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM183BQ1AE95 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM183BQ1AE95 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM183BQ1AE95 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM183BQ1AE95 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM183BQ1AE95 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM183BQ1AE95 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM183BQ1AE95 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM183BQ1AE95 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM183BQ1AE95 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM183BQ1AE95 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM183BQ1AE95 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM183BQ1AE95 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM183BQ1AE95 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM183BQ1AE95 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM183BQ1AE95 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM183BQ1AE95 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM183BQ1AE95 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM183BQ1AE95 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM183BQ1AE95 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM183BQ1AE95 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM183BQ1AE95 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM183BQ1AE95 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM183BQ1AE95 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM183BQ1AE95 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM183BQ1AE95 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM183BQ1AE95 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM183BQ1AE95 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM183BQ1AE95 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM183BQ1AE95 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM183BQ1AE95 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM183BQ1AE95 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM183BQ1AE95 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM183BQ1AE95 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM183BQ1AE95 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM183BQ1AE95 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM183BQ1AE95 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM183BQ1AE95 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM183BQ1AE95 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM183BQ1AE95 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM183BQ1AE95 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM183BQ1AE95 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM183BQ1AE95 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM183BQ1AE95 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM183BQ1AE95 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM183BQ1AE95 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM183BQ1AE95 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM183BQ1AE95 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM183BQ1AE95 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM183BQ1AE95 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM183BQ1AE95 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM183BQ1AE95 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM183BQ1AE95 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM183BQ1AE95 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM183BQ1AE95 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM183BQ1AE95 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM183BQ1AE95 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM183BQ1AE95 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM183BQ1AE95 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM183BQ1AE95 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM183BQ1AE95 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM183BQ1AE95 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM183BQ1AE95 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM183BQ1AE95 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM183BQ1AE95 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM183BQ1AE95 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM183BQ1AE95 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM183BQ1AE95 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM183BQ1AE95 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM183BQ1AE95 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM183BQ1AE95 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms