Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CHRNA2Q15822 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CHRNA2Q15822 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CHRNA2Q15822 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CHRNA2Q15822 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CHRNA2Q15822 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CHRNA2Q15822 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CHRNA2Q15822 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CHRNA2Q15822 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CHRNA2Q15822 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CHRNA2Q15822 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CHRNA2Q15822 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CHRNA2Q15822 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CHRNA2Q15822 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CHRNA2Q15822 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CHRNA2Q15822 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CHRNA2Q15822 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CHRNA2Q15822 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CHRNA2Q15822 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CHRNA2Q15822 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CHRNA2Q15822 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
CHRNA2Q15822 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CHRNA2Q15822 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CHRNA2Q15822 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CHRNA2Q15822 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CHRNA2Q15822 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CHRNA2Q15822 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CHRNA2Q15822 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CHRNA2Q15822 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CHRNA2Q15822 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CHRNA2Q15822 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CHRNA2Q15822 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CHRNA2Q15822 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
CHRNA2Q15822 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
CHRNA2Q15822 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CHRNA2Q15822 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CHRNA2Q15822 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
CHRNA2Q15822 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CHRNA2Q15822 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CHRNA2Q15822 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CHRNA2Q15822 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CHRNA2Q15822 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CHRNA2Q15822 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CHRNA2Q15822 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CHRNA2Q15822 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CHRNA2Q15822 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CHRNA2Q15822 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
CHRNA2Q15822 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CHRNA2Q15822 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CHRNA2Q15822 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
CHRNA2Q15822 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CHRNA2Q15822 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CHRNA2Q15822 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CHRNA2Q15822 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CHRNA2Q15822 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CHRNA2Q15822 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CHRNA2Q15822 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CHRNA2Q15822 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CHRNA2Q15822 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
CHRNA2Q15822 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CHRNA2Q15822 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CHRNA2Q15822 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CHRNA2Q15822 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CHRNA2Q15822 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CHRNA2Q15822 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CHRNA2Q15822 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CHRNA2Q15822 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CHRNA2Q15822 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
CHRNA2Q15822 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CHRNA2Q15822 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CHRNA2Q15822 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CHRNA2Q15822 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CHRNA2Q15822 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
CHRNA2Q15822 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
CHRNA2Q15822 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
CHRNA2Q15822 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CHRNA2Q15822 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CHRNA2Q15822 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CHRNA2Q15822 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CHRNA2Q15822 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CHRNA2Q15822 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CHRNA2Q15822 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CHRNA2Q15822 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CHRNA2Q15822 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CHRNA2Q15822 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CHRNA2Q15822 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CHRNA2Q15822 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
CHRNA2Q15822 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CHRNA2Q15822 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CHRNA2Q15822 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CHRNA2Q15822 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CHRNA2Q15822 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CHRNA2Q15822 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
CHRNA2Q15822 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
CHRNA2Q15822 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CHRNA2Q15822 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CHRNA2Q15822 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CHRNA2Q15822 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CHRNA2Q15822 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CHRNA2Q15822 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms