Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SS18Q15532 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SS18Q15532 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SS18Q15532 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SS18Q15532 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SS18Q15532 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SS18Q15532 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SS18Q15532 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SS18Q15532 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SS18Q15532 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SS18Q15532 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SS18Q15532 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SS18Q15532 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SS18Q15532 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SS18Q15532 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SS18Q15532 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SS18Q15532 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SS18Q15532 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SS18Q15532 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SS18Q15532 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SS18Q15532 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SS18Q15532 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SS18Q15532 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SS18Q15532 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SS18Q15532 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SS18Q15532 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SS18Q15532 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SS18Q15532 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SS18Q15532 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SS18Q15532 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SS18Q15532 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SS18Q15532 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SS18Q15532 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SS18Q15532 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SS18Q15532 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SS18Q15532 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SS18Q15532 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SS18Q15532 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SS18Q15532 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SS18Q15532 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SS18Q15532 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SS18Q15532 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SS18Q15532 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SS18Q15532 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SS18Q15532 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SS18Q15532 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SS18Q15532 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SS18Q15532 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SS18Q15532 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SS18Q15532 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SS18Q15532 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SS18Q15532 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SS18Q15532 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SS18Q15532 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SS18Q15532 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SS18Q15532 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SS18Q15532 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SS18Q15532 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SS18Q15532 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SS18Q15532 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SS18Q15532 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SS18Q15532 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18Q15532 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18Q15532 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18Q15532 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18Q15532 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18Q15532 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18Q15532 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18Q15532 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18Q15532 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18Q15532 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18Q15532 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18Q15532 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18Q15532 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18Q15532 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18Q15532 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SS18Q15532 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SS18Q15532 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SS18Q15532 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SS18Q15532 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SS18Q15532 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SS18Q15532 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SS18Q15532 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SS18Q15532 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SS18Q15532 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SS18Q15532 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SS18Q15532 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SS18Q15532 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SS18Q15532 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SS18Q15532 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SS18Q15532 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SS18Q15532 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SS18Q15532 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SS18Q15532 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SS18Q15532 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SS18Q15532 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SS18Q15532 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SS18Q15532 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SS18Q15532 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SS18Q15532 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms