Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3A2Q15428 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3A2Q15428 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3A2Q15428 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3A2Q15428 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3A2Q15428 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3A2Q15428 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SF3A2Q15428 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SF3A2Q15428 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SF3A2Q15428 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SF3A2Q15428 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SF3A2Q15428 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SF3A2Q15428 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SF3A2Q15428 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SF3A2Q15428 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SF3A2Q15428 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SF3A2Q15428 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SF3A2Q15428 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3A2Q15428 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3A2Q15428 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3A2Q15428 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3A2Q15428 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3A2Q15428 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3A2Q15428 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3A2Q15428 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SF3A2Q15428 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SF3A2Q15428 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SF3A2Q15428 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SF3A2Q15428 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3A2Q15428 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3A2Q15428 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3A2Q15428 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SF3A2Q15428 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SF3A2Q15428 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SF3A2Q15428 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SF3A2Q15428 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SF3A2Q15428 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SF3A2Q15428 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SF3A2Q15428 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3A2Q15428 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3A2Q15428 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SF3A2Q15428 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3A2Q15428 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3A2Q15428 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3A2Q15428 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SF3A2Q15428 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SF3A2Q15428 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SF3A2Q15428 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SF3A2Q15428 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3A2Q15428 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3A2Q15428 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3A2Q15428 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SF3A2Q15428 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SF3A2Q15428 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SF3A2Q15428 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SF3A2Q15428 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SF3A2Q15428 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3A2Q15428 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3A2Q15428 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3A2Q15428 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SF3A2Q15428 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SF3A2Q15428 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SF3A2Q15428 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SF3A2Q15428 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SF3A2Q15428 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SF3A2Q15428 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3A2Q15428 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3A2Q15428 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3A2Q15428 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3A2Q15428 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3A2Q15428 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3A2Q15428 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3A2Q15428 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SF3A2Q15428 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3A2Q15428 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3A2Q15428 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3A2Q15428 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SF3A2Q15428 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SF3A2Q15428 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3A2Q15428 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3A2Q15428 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3A2Q15428 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3A2Q15428 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3A2Q15428 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3A2Q15428 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3A2Q15428 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3A2Q15428 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3A2Q15428 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3A2Q15428 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3A2Q15428 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3A2Q15428 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3A2Q15428 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3A2Q15428 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SF3A2Q15428 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SF3A2Q15428 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SF3A2Q15428 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3A2Q15428 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3A2Q15428 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3A2Q15428 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3A2Q15428 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms