Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC2Q13868 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC2Q13868 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC2Q13868 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC2Q13868 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC2Q13868 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC2Q13868 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC2Q13868 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC2Q13868 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC2Q13868 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC2Q13868 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC2Q13868 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC2Q13868 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC2Q13868 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EXOSC2Q13868 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC2Q13868 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC2Q13868 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC2Q13868 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC2Q13868 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC2Q13868 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC2Q13868 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC2Q13868 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC2Q13868 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC2Q13868 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC2Q13868 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC2Q13868 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC2Q13868 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC2Q13868 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC2Q13868 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC2Q13868 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC2Q13868 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC2Q13868 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC2Q13868 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC2Q13868 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC2Q13868 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC2Q13868 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC2Q13868 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC2Q13868 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC2Q13868 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC2Q13868 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC2Q13868 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC2Q13868 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC2Q13868 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC2Q13868 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC2Q13868 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC2Q13868 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC2Q13868 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC2Q13868 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC2Q13868 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC2Q13868 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC2Q13868 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC2Q13868 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC2Q13868 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC2Q13868 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC2Q13868 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC2Q13868 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC2Q13868 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC2Q13868 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC2Q13868 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC2Q13868 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC2Q13868 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC2Q13868 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC2Q13868 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC2Q13868 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC2Q13868 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC2Q13868 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC2Q13868 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC2Q13868 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC2Q13868 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC2Q13868 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC2Q13868 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC2Q13868 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC2Q13868 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC2Q13868 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC2Q13868 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC2Q13868 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC2Q13868 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC2Q13868 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC2Q13868 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC2Q13868 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC2Q13868 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC2Q13868 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC2Q13868 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC2Q13868 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC2Q13868 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC2Q13868 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC2Q13868 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC2Q13868 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC2Q13868 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC2Q13868 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC2Q13868 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC2Q13868 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC2Q13868 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EXOSC2Q13868 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC2Q13868 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC2Q13868 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC2Q13868 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC2Q13868 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC2Q13868 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC2Q13868 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
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