Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRQ13535 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRQ13535 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRQ13535 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRQ13535 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRQ13535 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRQ13535 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATRQ13535 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRQ13535 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRQ13535 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRQ13535 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRQ13535 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRQ13535 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRQ13535 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRQ13535 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRQ13535 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRQ13535 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRQ13535 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRQ13535 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRQ13535 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRQ13535 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATRQ13535 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRQ13535 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRQ13535 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRQ13535 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATRQ13535 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATRQ13535 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRQ13535 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRQ13535 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRQ13535 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRQ13535 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRQ13535 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRQ13535 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRQ13535 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRQ13535 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRQ13535 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRQ13535 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRQ13535 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATRQ13535 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRQ13535 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRQ13535 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRQ13535 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRQ13535 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRQ13535 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATRQ13535 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRQ13535 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRQ13535 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRQ13535 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATRQ13535 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRQ13535 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRQ13535 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRQ13535 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRQ13535 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRQ13535 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRQ13535 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATRQ13535 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRQ13535 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRQ13535 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRQ13535 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRQ13535 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRQ13535 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRQ13535 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRQ13535 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRQ13535 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATRQ13535 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRQ13535 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRQ13535 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRQ13535 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRQ13535 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATRQ13535 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRQ13535 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATRQ13535 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRQ13535 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRQ13535 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRQ13535 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRQ13535 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRQ13535 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRQ13535 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRQ13535 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRQ13535 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRQ13535 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATRQ13535 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATRQ13535 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATRQ13535 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATRQ13535 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRQ13535 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRQ13535 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRQ13535 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRQ13535 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRQ13535 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATRQ13535 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRQ13535 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRQ13535 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRQ13535 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATRQ13535 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRQ13535 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATRQ13535 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRQ13535 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRQ13535 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATRQ13535 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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