Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBB3Q13509 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBB3Q13509 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBB3Q13509 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBB3Q13509 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBB3Q13509 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBB3Q13509 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBB3Q13509 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBB3Q13509 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBB3Q13509 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUBB3Q13509 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUBB3Q13509 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUBB3Q13509 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBB3Q13509 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBB3Q13509 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBB3Q13509 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBB3Q13509 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBB3Q13509 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBB3Q13509 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBB3Q13509 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBB3Q13509 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBB3Q13509 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TUBB3Q13509 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBB3Q13509 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBB3Q13509 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBB3Q13509 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBB3Q13509 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBB3Q13509 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBB3Q13509 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBB3Q13509 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBB3Q13509 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBB3Q13509 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBB3Q13509 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBB3Q13509 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBB3Q13509 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUBB3Q13509 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUBB3Q13509 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TUBB3Q13509 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBB3Q13509 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBB3Q13509 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBB3Q13509 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBB3Q13509 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBB3Q13509 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBB3Q13509 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBB3Q13509 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBB3Q13509 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBB3Q13509 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TUBB3Q13509 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBB3Q13509 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBB3Q13509 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBB3Q13509 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBB3Q13509 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBB3Q13509 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBB3Q13509 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBB3Q13509 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBB3Q13509 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBB3Q13509 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBB3Q13509 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBB3Q13509 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBB3Q13509 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBB3Q13509 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBB3Q13509 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBB3Q13509 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBB3Q13509 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBB3Q13509 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBB3Q13509 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBB3Q13509 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBB3Q13509 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBB3Q13509 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBB3Q13509 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBB3Q13509 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBB3Q13509 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBB3Q13509 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB3Q13509 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB3Q13509 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB3Q13509 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB3Q13509 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBB3Q13509 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBB3Q13509 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBB3Q13509 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBB3Q13509 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBB3Q13509 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBB3Q13509 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBB3Q13509 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBB3Q13509 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBB3Q13509 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBB3Q13509 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBB3Q13509 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBB3Q13509 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBB3Q13509 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBB3Q13509 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBB3Q13509 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBB3Q13509 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBB3Q13509 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBB3Q13509 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBB3Q13509 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBB3Q13509 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBB3Q13509 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBB3Q13509 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBB3Q13509 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
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