Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 ALDH1A1-202ENST00000376939 822 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.971e-7■■■■■ 28
G3BP1Q13283 RPS6KA3-202ENST00000438357 530 ntTSL 518.37■□□□□ 0.534e-9■■■■■ 27.9
G3BP1Q13283 RPS6KA3-206ENST00000492128 553 ntTSL 411.13□□□□□ -0.634e-9■■■■■ 27.9
G3BP1Q13283 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.797e-7■■■■■ 27.8
G3BP1Q13283 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.617e-7■■■■■ 27.8
G3BP1Q13283 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.57e-7■■■■■ 27.8
G3BP1Q13283 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.097e-7■■■■■ 27.8
G3BP1Q13283 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.157e-7■■■■■ 27.8
G3BP1Q13283 WDR1-217ENST00000515018 274 ntTSL 39.36□□□□□ -0.915e-10■■■■■ 27.7
G3BP1Q13283 HADHA-202ENST00000461025 431 ntTSL 313.84□□□□□ -0.194e-8■■■■■ 27.7
G3BP1Q13283 C20orf24-205ENST00000491113 734 ntTSL 232.27■■■□□ 2.765e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.415e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.415e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.45e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 C20orf24-206ENST00000492721 1044 ntTSL 226.74■■□□□ 1.875e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 C20orf24-204ENST00000483815 1170 ntTSL 1 (best)22.28■■□□□ 1.165e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.765e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.75e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 DDC-210ENST00000494914 891 ntTSL 214.58□□□□□ -0.085e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 C20orf24-207ENST00000494506 874 ntTSL 29.72□□□□□ -0.855e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 TRIP12-216ENST00000487178 977 ntTSL 27.18□□□□□ -1.265e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 IQGAP2-212ENST00000509741 394 ntTSL 26.36□□□□□ -1.395e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 NUP205-206ENST00000477620 1800 ntTSL 55.56□□□□□ -1.525e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.815e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 PDCD4-202ENST00000393104 3697 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.295e-8■■■■■ 27.5
G3BP1Q13283 PDCD4-201ENST00000280154 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.685e-8■■■■■ 27.5
G3BP1Q13283 PDCD4-207ENST00000483595 531 ntTSL 58.05□□□□□ -1.125e-8■■■■■ 27.5
G3BP1Q13283 PDCD4-204ENST00000462577 789 ntTSL 56.39□□□□□ -1.395e-8■■■■■ 27.5
G3BP1Q13283 EIF4A3-208ENST00000576573 697 ntTSL 29.65□□□□□ -0.869e-7■■■■■ 27.4
G3BP1Q13283 PUF60-214ENST00000529693 684 ntTSL 221.64■■□□□ 1.051e-6■■■■■ 27.4
G3BP1Q13283 PUF60-213ENST00000528999 431 ntTSL 313.02□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 27.4
G3BP1Q13283 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.131e-7■■■■■ 27.4
G3BP1Q13283 RRN3-201ENST00000198767 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.721e-7■■■■■ 27.4
G3BP1Q13283 RRN3-203ENST00000429751 2198 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 27.4
G3BP1Q13283 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.161e-7■■■■■ 27.4
G3BP1Q13283 RRN3-204ENST00000561685 615 ntTSL 52.72□□□□□ -1.971e-7■■■■■ 27.4
G3BP1Q13283 VARS-216ENST00000428445 863 ntTSL 520.41■□□□□ 0.868e-7■■■■■ 27.3
G3BP1Q13283 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.651e-7■■■■■ 27.3
G3BP1Q13283 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.081e-7■■■■■ 27.3
G3BP1Q13283 CAPNS1-212ENST00000591041 812 ntTSL 327.92■■■□□ 2.061e-7■■■■■ 27.3
G3BP1Q13283 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.861e-7■■■■■ 27.3
G3BP1Q13283 NUP205-210ENST00000607647 4518 ntTSL 56.9□□□□□ -1.32e-7■■■■■ 27.3
G3BP1Q13283 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.522e-7■■■■■ 27.3
G3BP1Q13283 PPME1-204ENST00000538501 744 ntTSL 1 (best)8.85□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 27.3
G3BP1Q13283 PPME1-206ENST00000541340 3618 ntTSL 1 (best)8.4□□□□□ -1.061e-6■■■■■ 27.3
G3BP1Q13283 VPS35-211ENST00000569950 1096 ntTSL 511.5□□□□□ -0.571e-8■■■■■ 27.2
G3BP1Q13283 SPTAN1-207ENST00000476825 635 ntTSL 311.27□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 27.2
G3BP1Q13283 PDCD4-205ENST00000467574 735 ntTSL 332.18■■■□□ 2.744e-14■■■■■ 27.2
G3BP1Q13283 PDCD4-203ENST00000444997 819 ntTSL 321.54■■□□□ 1.044e-14■■■■■ 27.2
G3BP1Q13283 PDCD4-210ENST00000492932 813 ntTSL 314.35□□□□□ -0.114e-14■■■■■ 27.2
G3BP1Q13283 PDCD4-206ENST00000481353 1120 ntTSL 29.46□□□□□ -0.94e-14■■■■■ 27.2
G3BP1Q13283 PDCD4-209ENST00000489049 547 ntTSL 28.05□□□□□ -1.124e-14■■■■■ 27.2
G3BP1Q13283 PHB-208ENST00000507748 582 ntTSL 1 (best)6.19□□□□□ -1.423e-10■■■■■ 27.2
G3BP1Q13283 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.043e-12■■■■■ 27.1
G3BP1Q13283 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.53e-12■■■■■ 27.1
G3BP1Q13283 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.453e-12■■■■■ 27.1
G3BP1Q13283 PSME1-210ENST00000561435 945 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.23e-12■■■■■ 27.1
G3BP1Q13283 PSME1-206ENST00000559741 763 ntTSL 312.41□□□□□ -0.423e-12■■■■■ 27.1
G3BP1Q13283 CCT8-202ENST00000431234 968 ntTSL 55.14□□□□□ -1.592e-7■■■■■ 27.1
G3BP1Q13283 LDHA-215ENST00000537296 1511 ntTSL 213.42□□□□□ -0.268e-16■■■■■ 27.1
G3BP1Q13283 TLN1-207ENST00000489255 798 ntTSL 216.21■□□□□ 0.196e-8■■■■■ 27
G3BP1Q13283 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.33e-7■■■■■ 27
G3BP1Q13283 ZSWIM8-204ENST00000431225 1687 ntTSL 522.11■■□□□ 1.133e-7■■■■■ 27
G3BP1Q13283 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.93e-7■■■■■ 27
G3BP1Q13283 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.863e-7■■■■■ 27
G3BP1Q13283 ZSWIM8-205ENST00000433366 5773 ntTSL 520.28■□□□□ 0.843e-7■■■■■ 27
G3BP1Q13283 POLR3A-203ENST00000473588 1022 ntTSL 519.43■□□□□ 0.73e-7■■■■■ 27
G3BP1Q13283 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.63e-7■■■■■ 27
G3BP1Q13283 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.573e-7■■■■■ 27
G3BP1Q13283 RNF213-218ENST00000574060 540 ntTSL 216.58■□□□□ 0.243e-7■■■■■ 27
G3BP1Q13283 PRRC2B-209ENST00000489593 797 ntTSL 216.5■□□□□ 0.233e-7■■■■■ 27
G3BP1Q13283 RNF181-205ENST00000456023 559 ntTSL 316.03■□□□□ 0.163e-20■■■■■ 27
G3BP1Q13283 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.163e-20■■■■■ 27
G3BP1Q13283 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.163e-20■■■■■ 27
G3BP1Q13283 POLR3A-202ENST00000472014 699 ntTSL 315.51■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 27
G3BP1Q13283 RNF181-206ENST00000461845 623 ntTSL 215.05■□□□□ -03e-20■■■■■ 27
G3BP1Q13283 ZSWIM8-212ENST00000492395 4490 ntTSL 1 (best)15.03■□□□□ -03e-7■■■■■ 27
G3BP1Q13283 RNF181-204ENST00000443647 535 ntTSL 213.56□□□□□ -0.243e-20■■■■■ 27
G3BP1Q13283 RNF181-202ENST00000414390 327 ntTSL 213.46□□□□□ -0.253e-20■■■■■ 27
G3BP1Q13283 ALDH1A1-201ENST00000297785 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 26.9
G3BP1Q13283 LDHA-202ENST00000375710 2169 ntTSL 28.22□□□□□ -1.097e-16■■■■■ 26.9
G3BP1Q13283 TGM2-205ENST00000469269 3467 ntTSL 213□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 26.9
G3BP1Q13283 MCM4-216ENST00000524086 547 ntTSL 515.59■□□□□ 0.097e-8■■■■■ 26.8
G3BP1Q13283 MCM4-207ENST00000519170 734 ntTSL 314.33□□□□□ -0.127e-8■■■■■ 26.8
G3BP1Q13283 MCM4-203ENST00000518221 572 ntTSL 413.73□□□□□ -0.217e-8■■■■■ 26.8
G3BP1Q13283 MYL12A-205ENST00000578562 623 ntTSL 31.93□□□□□ -2.12e-7■■■■■ 26.8
G3BP1Q13283 MCM2-204ENST00000472731 547 ntTSL 217.6■□□□□ 0.414e-7■■■■□ 26.7
G3BP1Q13283 ILF2-203ENST00000368684 476 ntTSL 58.13□□□□□ -1.112e-6■■■■□ 26.7
G3BP1Q13283 LDHA-210ENST00000486690 664 ntTSL 59□□□□□ -0.978e-16■■■■□ 26.7
G3BP1Q13283 MCM2-203ENST00000468659 557 ntTSL 426.22■■□□□ 1.792e-7■■■■□ 26.7
G3BP1Q13283 DIAPH1-208ENST00000476339 2606 ntTSL 213.97□□□□□ -0.171e-6■■■■□ 26.7
G3BP1Q13283 FAM98A-206ENST00000475122 1032 ntTSL 1 (best)27.25■■□□□ 1.951e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.851e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.841e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 UBOX5-203ENST00000449731 524 ntTSL 519.95■□□□□ 0.781e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 AIFM1-204ENST00000416073 2248 ntTSL 1 (best)18.81■□□□□ 0.61e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.581e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.541e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.541e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.481e-7■■■■□ 26.6
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