Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 YCR102CYCR102C 1107 nt9.13□□□□□ -0.95
TY1A-NL1Q12391 SGT2YOR007C 1041 nt9.13□□□□□ -0.95
TY1A-NL1Q12391 UTP6YDR449C 1323 nt9.12□□□□□ -0.95
TY1A-NL1Q12391 ARP6YLR085C 1317 nt9.12□□□□□ -0.95
TY1A-NL1Q12391 YJL118WYJL118W 660 nt9.12□□□□□ -0.95
TY1A-NL1Q12391 HUA1YGR268C 597 nt9.1□□□□□ -0.95
TY1A-NL1Q12391 PRM5YIL117C 957 nt9.08□□□□□ -0.96
TY1A-NL1Q12391 YJR154WYJR154W 1041 nt9.08□□□□□ -0.96
TY1A-NL1Q12391 NDI1YML120C 1542 nt9.08□□□□□ -0.96
TY1A-NL1Q12391 YNL115CYNL115C 1935 nt9.07□□□□□ -0.96
TY1A-NL1Q12391 HIF1YLL022C 1158 nt9.07□□□□□ -0.96
TY1A-NL1Q12391 HMT1YBR034C 1047 nt9.07□□□□□ -0.96
TY1A-NL1Q12391 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt9.06□□□□□ -0.96
TY1A-NL1Q12391 ALD4YOR374W 1560 nt9.05□□□□□ -0.96
TY1A-NL1Q12391 PEX25YPL112C 1185 nt9.04□□□□□ -0.96
TY1A-NL1Q12391 YHM2YMR241W 945 nt9.01□□□□□ -0.97
TY1A-NL1Q12391 PET20YPL159C 762 nt9.01□□□□□ -0.97
TY1A-NL1Q12391 UTR1YJR049C 1593 nt8.99□□□□□ -0.97
TY1A-NL1Q12391 VPS75YNL246W 795 nt8.99□□□□□ -0.97
TY1A-NL1Q12391 YPL071CYPL071C 471 nt8.98□□□□□ -0.97
TY1A-NL1Q12391 HSL7YBR133C 2484 nt8.97□□□□□ -0.97
TY1A-NL1Q12391 SPT20YOL148C 1815 nt8.97□□□□□ -0.97
TY1A-NL1Q12391 TIR3YIL011W 810 nt8.97□□□□□ -0.97
TY1A-NL1Q12391 RPC82YPR190C 1965 nt8.97□□□□□ -0.97
TY1A-NL1Q12391 INA1YLR413W 2028 nt8.97□□□□□ -0.97
TY1A-NL1Q12391 LSC2YGR244C 1284 nt8.96□□□□□ -0.98
TY1A-NL1Q12391 GAP1YKR039W 1809 nt8.96□□□□□ -0.98
TY1A-NL1Q12391 VAR1Q0140 1197 nt8.95□□□□□ -0.98
TY1A-NL1Q12391 SKG1YKR100C 1068 nt8.94□□□□□ -0.98
TY1A-NL1Q12391 YCR099CYCR099C 468 nt8.93□□□□□ -0.98
TY1A-NL1Q12391 YFL066CYFL066C 1179 nt8.93□□□□□ -0.98
TY1A-NL1Q12391 SAM35YHR083W 990 nt8.93□□□□□ -0.98
TY1A-NL1Q12391 MRPL8YJL063C 717 nt8.93□□□□□ -0.98
TY1A-NL1Q12391 SHH4YLR164W 507 nt8.93□□□□□ -0.98
TY1A-NL1Q12391 PAB1YER165W 1734 nt8.92□□□□□ -0.98
TY1A-NL1Q12391 ADO1YJR105W 1023 nt8.92□□□□□ -0.98
TY1A-NL1Q12391 PRO1YDR300C 1287 nt8.91□□□□□ -0.98
TY1A-NL1Q12391 snR78snR78 87 nt8.9□□□□□ -0.98
TY1A-NL1Q12391 ZRT3YKL175W 1512 nt8.88□□□□□ -0.99
TY1A-NL1Q12391 POM34YLR018C 900 nt8.87□□□□□ -0.99
TY1A-NL1Q12391 YPL041CYPL041C 624 nt8.87□□□□□ -0.99
TY1A-NL1Q12391 ATG15YCR068W 1563 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1A-NL1Q12391 YFR018CYFR018C 1092 nt8.84□□□□□ -0.99
TY1A-NL1Q12391 COG1YGL223C 1254 nt8.84□□□□□ -0.99
TY1A-NL1Q12391 PAU7YAR020C 168 nt8.84□□□□□ -0.99
TY1A-NL1Q12391 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.83□□□□□ -1
TY1A-NL1Q12391 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.83□□□□□ -1
TY1A-NL1Q12391 YML089CYML089C 369 nt8.82□□□□□ -1
TY1A-NL1Q12391 FTH1YBR207W 1398 nt8.81□□□□□ -1
TY1A-NL1Q12391 YDR010CYDR010C 333 nt8.8□□□□□ -1
TY1A-NL1Q12391 DIF1YLR437C 402 nt8.8□□□□□ -1
TY1A-NL1Q12391 SFA1YDL168W 1161 nt8.79□□□□□ -1
TY1A-NL1Q12391 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.79□□□□□ -1
TY1A-NL1Q12391 YJL067WYJL067W 351 nt8.79□□□□□ -1
TY1A-NL1Q12391 SHB17YKR043C 816 nt8.79□□□□□ -1
TY1A-NL1Q12391 DBP1YPL119C 1854 nt8.79□□□□□ -1
TY1A-NL1Q12391 PRE6YOL038W 765 nt8.78□□□□□ -1
TY1A-NL1Q12391 HXT1YHR094C 1713 nt8.77□□□□□ -1
TY1A-NL1Q12391 AI3Q0060 1248 nt8.77□□□□□ -1.01
TY1A-NL1Q12391 YNR068CYNR068C 819 nt8.76□□□□□ -1.01
TY1A-NL1Q12391 TOM6YOR045W 186 nt8.76□□□□□ -1.01
TY1A-NL1Q12391 RET2YFR051C 1641 nt8.74□□□□□ -1.01
TY1A-NL1Q12391 URE2YNL229C 1065 nt8.72□□□□□ -1.01
TY1A-NL1Q12391 SHY1YGR112W 1170 nt8.71□□□□□ -1.02
TY1A-NL1Q12391 YJL107CYJL107C 1164 nt8.7□□□□□ -1.02
TY1A-NL1Q12391 MIR1YJR077C 936 nt8.7□□□□□ -1.02
TY1A-NL1Q12391 TIF6YPR016C 738 nt8.7□□□□□ -1.02
TY1A-NL1Q12391 YTH1YPR107C 627 nt8.7□□□□□ -1.02
TY1A-NL1Q12391 MUP1YGR055W 1725 nt8.69□□□□□ -1.02
TY1A-NL1Q12391 PEX2YJL210W 816 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1A-NL1Q12391 YBL086CYBL086C 1401 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1A-NL1Q12391 HOL1YNR055C 1761 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1A-NL1Q12391 RIM8YGL045W 1629 nt8.67□□□□□ -1.02
TY1A-NL1Q12391 BNS1YGR230W 414 nt8.67□□□□□ -1.02
TY1A-NL1Q12391 RPM1RPM1 483 nt8.67□□□□□ -1.02
TY1A-NL1Q12391 PHO89YBR296C 1725 nt8.67□□□□□ -1.02
TY1A-NL1Q12391 HIP1YGR191W 1812 nt8.66□□□□□ -1.02
TY1A-NL1Q12391 UBA4YHR111W 1323 nt8.66□□□□□ -1.02
TY1A-NL1Q12391 YAR028WYAR028W 705 nt8.66□□□□□ -1.02
TY1A-NL1Q12391 LIP1YMR298W 453 nt8.66□□□□□ -1.02
TY1A-NL1Q12391 SED1YDR077W 1017 nt8.65□□□□□ -1.02
TY1A-NL1Q12391 ILV3YJR016C 1758 nt8.65□□□□□ -1.02
TY1A-NL1Q12391 THP3YPR045C 1413 nt8.64□□□□□ -1.03
TY1A-NL1Q12391 RRT5YFR032C 870 nt8.64□□□□□ -1.03
TY1A-NL1Q12391 RSM23YGL129C 1353 nt8.63□□□□□ -1.03
TY1A-NL1Q12391 HEL2YDR266C 1920 nt8.63□□□□□ -1.03
TY1A-NL1Q12391 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.63□□□□□ -1.03
TY1A-NL1Q12391 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.63□□□□□ -1.03
TY1A-NL1Q12391 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.63□□□□□ -1.03
TY1A-NL1Q12391 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.63□□□□□ -1.03
TY1A-NL1Q12391 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.63□□□□□ -1.03
TY1A-NL1Q12391 YGL114WYGL114W 2178 nt8.63□□□□□ -1.03
TY1A-NL1Q12391 YNL024CYNL024C 741 nt8.62□□□□□ -1.03
TY1A-NL1Q12391 COQ2YNR041C 1119 nt8.61□□□□□ -1.03
TY1A-NL1Q12391 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.6□□□□□ -1.03
TY1A-NL1Q12391 MET28YIR017C 564 nt8.6□□□□□ -1.03
TY1A-NL1Q12391 REC114YMR133W 1287 nt8.6□□□□□ -1.03
TY1A-NL1Q12391 YOR325WYOR325W 474 nt8.6□□□□□ -1.03
TY1A-NL1Q12391 MTG2YHR168W 1557 nt8.6□□□□□ -1.03
TY1A-NL1Q12391 URA6YKL024C 615 nt8.59□□□□□ -1.03
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