Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG06

FAAP100, Fanconi anemia core complex-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP100Q0VG06 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FAAP100Q0VG06 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FAAP100Q0VG06 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FAAP100Q0VG06 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FAAP100Q0VG06 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FAAP100Q0VG06 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
FAAP100Q0VG06 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FAAP100Q0VG06 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FAAP100Q0VG06 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FAAP100Q0VG06 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FAAP100Q0VG06 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FAAP100Q0VG06 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FAAP100Q0VG06 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FAAP100Q0VG06 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FAAP100Q0VG06 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FAAP100Q0VG06 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FAAP100Q0VG06 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FAAP100Q0VG06 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FAAP100Q0VG06 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FAAP100Q0VG06 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FAAP100Q0VG06 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
FAAP100Q0VG06 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FAAP100Q0VG06 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FAAP100Q0VG06 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FAAP100Q0VG06 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FAAP100Q0VG06 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
FAAP100Q0VG06 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FAAP100Q0VG06 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FAAP100Q0VG06 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FAAP100Q0VG06 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FAAP100Q0VG06 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FAAP100Q0VG06 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FAAP100Q0VG06 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FAAP100Q0VG06 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FAAP100Q0VG06 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FAAP100Q0VG06 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FAAP100Q0VG06 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FAAP100Q0VG06 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FAAP100Q0VG06 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
FAAP100Q0VG06 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
FAAP100Q0VG06 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FAAP100Q0VG06 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FAAP100Q0VG06 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FAAP100Q0VG06 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FAAP100Q0VG06 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
FAAP100Q0VG06 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FAAP100Q0VG06 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FAAP100Q0VG06 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FAAP100Q0VG06 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FAAP100Q0VG06 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FAAP100Q0VG06 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FAAP100Q0VG06 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FAAP100Q0VG06 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
FAAP100Q0VG06 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
FAAP100Q0VG06 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FAAP100Q0VG06 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FAAP100Q0VG06 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FAAP100Q0VG06 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FAAP100Q0VG06 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FAAP100Q0VG06 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FAAP100Q0VG06 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FAAP100Q0VG06 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FAAP100Q0VG06 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FAAP100Q0VG06 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FAAP100Q0VG06 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FAAP100Q0VG06 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FAAP100Q0VG06 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FAAP100Q0VG06 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FAAP100Q0VG06 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FAAP100Q0VG06 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FAAP100Q0VG06 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FAAP100Q0VG06 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FAAP100Q0VG06 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FAAP100Q0VG06 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FAAP100Q0VG06 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FAAP100Q0VG06 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FAAP100Q0VG06 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
FAAP100Q0VG06 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
FAAP100Q0VG06 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FAAP100Q0VG06 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FAAP100Q0VG06 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
FAAP100Q0VG06 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FAAP100Q0VG06 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FAAP100Q0VG06 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FAAP100Q0VG06 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FAAP100Q0VG06 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FAAP100Q0VG06 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FAAP100Q0VG06 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FAAP100Q0VG06 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
FAAP100Q0VG06 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FAAP100Q0VG06 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30■■■□□ 2.39
FAAP100Q0VG06 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FAAP100Q0VG06 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FAAP100Q0VG06 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FAAP100Q0VG06 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FAAP100Q0VG06 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FAAP100Q0VG06 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
FAAP100Q0VG06 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FAAP100Q0VG06 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FAAP100Q0VG06 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms