Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAGPQ0VAQ4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMAGPQ0VAQ4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMAGPQ0VAQ4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAGPQ0VAQ4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAGPQ0VAQ4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAGPQ0VAQ4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAGPQ0VAQ4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAGPQ0VAQ4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAGPQ0VAQ4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAGPQ0VAQ4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAGPQ0VAQ4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMAGPQ0VAQ4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAGPQ0VAQ4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMAGPQ0VAQ4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMAGPQ0VAQ4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAGPQ0VAQ4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMAGPQ0VAQ4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMAGPQ0VAQ4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMAGPQ0VAQ4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMAGPQ0VAQ4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMAGPQ0VAQ4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMAGPQ0VAQ4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMAGPQ0VAQ4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMAGPQ0VAQ4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMAGPQ0VAQ4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMAGPQ0VAQ4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMAGPQ0VAQ4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAGPQ0VAQ4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAGPQ0VAQ4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAGPQ0VAQ4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAGPQ0VAQ4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAGPQ0VAQ4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAGPQ0VAQ4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAGPQ0VAQ4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAGPQ0VAQ4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAGPQ0VAQ4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAGPQ0VAQ4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAGPQ0VAQ4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAGPQ0VAQ4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMAGPQ0VAQ4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMAGPQ0VAQ4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMAGPQ0VAQ4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMAGPQ0VAQ4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMAGPQ0VAQ4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMAGPQ0VAQ4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAGPQ0VAQ4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAGPQ0VAQ4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAGPQ0VAQ4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAGPQ0VAQ4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAGPQ0VAQ4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAGPQ0VAQ4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAGPQ0VAQ4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAGPQ0VAQ4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAGPQ0VAQ4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAGPQ0VAQ4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAGPQ0VAQ4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAGPQ0VAQ4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAGPQ0VAQ4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAGPQ0VAQ4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAGPQ0VAQ4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAGPQ0VAQ4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAGPQ0VAQ4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAGPQ0VAQ4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAGPQ0VAQ4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAGPQ0VAQ4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAGPQ0VAQ4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMAGPQ0VAQ4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMAGPQ0VAQ4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAGPQ0VAQ4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAGPQ0VAQ4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAGPQ0VAQ4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAGPQ0VAQ4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAGPQ0VAQ4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAGPQ0VAQ4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAGPQ0VAQ4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAGPQ0VAQ4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAGPQ0VAQ4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAGPQ0VAQ4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAGPQ0VAQ4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAGPQ0VAQ4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAGPQ0VAQ4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAGPQ0VAQ4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAGPQ0VAQ4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMAGPQ0VAQ4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMAGPQ0VAQ4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMAGPQ0VAQ4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAGPQ0VAQ4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMAGPQ0VAQ4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMAGPQ0VAQ4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAGPQ0VAQ4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAGPQ0VAQ4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAGPQ0VAQ4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAGPQ0VAQ4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAGPQ0VAQ4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMAGPQ0VAQ4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMAGPQ0VAQ4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMAGPQ0VAQ4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMAGPQ0VAQ4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAGPQ0VAQ4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms