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Protein–RNA interactions for Protein: Q08490
SGO1, Shugoshin, yeast
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590 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SGO1
Q08490
RPS14B
YJL191W
417 nt
10.36
□□□□□ -0.75
SGO1
Q08490
YLR279W
YLR279W
390 nt
10.36
□□□□□ -0.75
SGO1
Q08490
YHL019W-A
YHL019W-A
594 nt
10.35
□□□□□ -0.75
SGO1
Q08490
AVT6
YER119C
1347 nt
10.33
□□□□□ -0.76
SGO1
Q08490
HHO1
YPL127C
777 nt
10.32
□□□□□ -0.76
SGO1
Q08490
AAC1
YMR056C
930 nt
10.31
□□□□□ -0.76
SGO1
Q08490
YJL195C
YJL195C
702 nt
10.3
□□□□□ -0.76
SGO1
Q08490
PRP4
YPR178W
1398 nt
10.29
□□□□□ -0.76
SGO1
Q08490
CLB6
YGR109C
1143 nt
10.29
□□□□□ -0.76
SGO1
Q08490
YCR102C
YCR102C
1107 nt
10.27
□□□□□ -0.77
SGO1
Q08490
RIB3
YDR487C
627 nt
10.27
□□□□□ -0.77
SGO1
Q08490
RAX1
YOR301W
1308 nt
10.27
□□□□□ -0.77
SGO1
Q08490
YGR012W
YGR012W
1182 nt
10.26
□□□□□ -0.77
SGO1
Q08490
DPS1
YLL018C
1674 nt
10.25
□□□□□ -0.77
SGO1
Q08490
BIO5
YNR056C
1686 nt
10.24
□□□□□ -0.77
SGO1
Q08490
UTH1
YKR042W
1098 nt
10.23
□□□□□ -0.77
SGO1
Q08490
TSC10
YBR265W
963 nt
10.23
□□□□□ -0.77
SGO1
Q08490
SHH4
YLR164W
507 nt
10.22
□□□□□ -0.77
SGO1
Q08490
GOR1
YNL274C
1053 nt
10.22
□□□□□ -0.77
SGO1
Q08490
PBP1
YGR178C
2169 nt
10.21
□□□□□ -0.77
SGO1
Q08490
ADH1
YOL086C
1047 nt
10.21
□□□□□ -0.77
SGO1
Q08490
GPN2
YOR262W
1044 nt
10.21
□□□□□ -0.77
SGO1
Q08490
ESS1
YJR017C
513 nt
10.2
□□□□□ -0.78
SGO1
Q08490
DUT1
YBR252W
444 nt
10.2
□□□□□ -0.78
SGO1
Q08490
TOM6
YOR045W
186 nt
10.17
□□□□□ -0.78
SGO1
Q08490
SNF1
YDR477W
1902 nt
10.17
□□□□□ -0.78
SGO1
Q08490
HIP1
YGR191W
1812 nt
10.16
□□□□□ -0.78
SGO1
Q08490
PEX2
YJL210W
816 nt
10.15
□□□□□ -0.78
SGO1
Q08490
CPD1
YGR247W
720 nt
10.14
□□□□□ -0.79
SGO1
Q08490
tS(GCU)L
tS(GCU)L
80 nt
10.14
□□□□□ -0.79
SGO1
Q08490
TIR3
YIL011W
810 nt
10.14
□□□□□ -0.79
SGO1
Q08490
CYT2
YKL087C
675 nt
10.14
□□□□□ -0.79
SGO1
Q08490
CMP2
YML057W
1815 nt
10.13
□□□□□ -0.79
SGO1
Q08490
YEL008W
YEL008W
381 nt
10.13
□□□□□ -0.79
SGO1
Q08490
HSL7
YBR133C
2484 nt
10.12
□□□□□ -0.79
SGO1
Q08490
CCA1
YER168C
1641 nt
10.12
□□□□□ -0.79
SGO1
Q08490
NRT1
YOR071C
1797 nt
10.12
□□□□□ -0.79
SGO1
Q08490
AGP1
YCL025C
1902 nt
10.11
□□□□□ -0.79
SGO1
Q08490
NBP35
YGL091C
987 nt
10.1
□□□□□ -0.79
SGO1
Q08490
YPI1
YFR003C
468 nt
10.09
□□□□□ -0.79
SGO1
Q08490
BMT6
YLR063W
1098 nt
10.09
□□□□□ -0.79
SGO1
Q08490
MSB4
YOL112W
1479 nt
10.09
□□□□□ -0.79
SGO1
Q08490
POM34
YLR018C
900 nt
10.08
□□□□□ -0.8
SGO1
Q08490
PUP1
YOR157C
786 nt
10.08
□□□□□ -0.8
SGO1
Q08490
YKR005C
YKR005C
1578 nt
10.06
□□□□□ -0.8
SGO1
Q08490
YPL222C-A
YPL222C-A
246 nt
10.05
□□□□□ -0.8
SGO1
Q08490
SEN2
YLR105C
1134 nt
10.04
□□□□□ -0.8
SGO1
Q08490
NAP1
YKR048C
1254 nt
10.03
□□□□□ -0.8
SGO1
Q08490
NME1
NME1
340 nt
10.03
□□□□□ -0.8
SGO1
Q08490
TIF6
YPR016C
738 nt
10.03
□□□□□ -0.8
SGO1
Q08490
MET28
YIR017C
564 nt
10.02
□□□□□ -0.81
SGO1
Q08490
YML089C
YML089C
369 nt
10.02
□□□□□ -0.81
SGO1
Q08490
LOT5
YKL183W
921 nt
10
□□□□□ -0.81
SGO1
Q08490
PRO1
YDR300C
1287 nt
9.99
□□□□□ -0.81
SGO1
Q08490
GND1
YHR183W
1470 nt
9.98
□□□□□ -0.81
SGO1
Q08490
YAT1
YAR035W
2064 nt
9.95
□□□□□ -0.82
SGO1
Q08490
LSC2
YGR244C
1284 nt
9.94
□□□□□ -0.82
SGO1
Q08490
ATG15
YCR068W
1563 nt
9.93
□□□□□ -0.82
SGO1
Q08490
FIT3
YOR383C
615 nt
9.93
□□□□□ -0.82
SGO1
Q08490
APT2
YDR441C
546 nt
9.91
□□□□□ -0.82
SGO1
Q08490
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YIR036C
792 nt
9.91
□□□□□ -0.82
SGO1
Q08490
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RDN25-1
3396 nt
9.91
□□□□□ -0.82
SGO1
Q08490
RDN25-2
RDN25-2
3396 nt
9.91
□□□□□ -0.82
SGO1
Q08490
YGR259C
YGR259C
441 nt
9.9
□□□□□ -0.82
SGO1
Q08490
PGC1
YPL206C
966 nt
9.9
□□□□□ -0.82
SGO1
Q08490
YBR232C
YBR232C
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9.88
□□□□□ -0.83
SGO1
Q08490
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YJR114W
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9.86
□□□□□ -0.83
SGO1
Q08490
AQY2
YLL052C
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9.85
□□□□□ -0.83
SGO1
Q08490
PAU5
YFL020C
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9.84
□□□□□ -0.83
SGO1
Q08490
STR3
YGL184C
1398 nt
9.84
□□□□□ -0.83
SGO1
Q08490
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YJL064W
396 nt
9.83
□□□□□ -0.84
SGO1
Q08490
HEL2
YDR266C
1920 nt
9.83
□□□□□ -0.84
SGO1
Q08490
RIB2
YOL066C
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9.83
□□□□□ -0.84
SGO1
Q08490
SMM1
YNR015W
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□□□□□ -0.84
SGO1
Q08490
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□□□□□ -0.84
SGO1
Q08490
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YCL074W
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SGO1
Q08490
DUS1
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Q08490
RDN18-1
RDN18-1
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Q08490
RDN18-2
RDN18-2
1800 nt
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Q08490
PAU19
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SGO1
Q08490
STP3
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YBR046C
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Q08490
TIM44
YIL022W
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SGO1
Q08490
SLG1
YOR008C
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□□□□□ -0.85
SGO1
Q08490
ARP6
YLR085C
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SGO1
Q08490
GAP1
YKR039W
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SGO1
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FCY21
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SGO1
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ALD4
YOR374W
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SGO1
Q08490
ALP1
YNL270C
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□□□□□ -0.85
SGO1
Q08490
HXT12
YIL170W
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□□□□□ -0.85
SGO1
Q08490
SPT20
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□□□□□ -0.85
SGO1
Q08490
AKR2
YOR034C
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9.7
□□□□□ -0.86
SGO1
Q08490
YAR028W
YAR028W
705 nt
9.7
□□□□□ -0.86
SGO1
Q08490
MTG2
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□□□□□ -0.86
SGO1
Q08490
PRY1
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□□□□□ -0.86
SGO1
Q08490
DIF1
YLR437C
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□□□□□ -0.86
SGO1
Q08490
RIB1
YBL033C
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□□□□□ -0.86
SGO1
Q08490
VRG4
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1014 nt
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□□□□□ -0.87
SGO1
Q08490
RIM8
YGL045W
1629 nt
9.64
□□□□□ -0.87
SGO1
Q08490
RPC82
YPR190C
1965 nt
9.63
□□□□□ -0.87
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