Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC3A1Q07837 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC3A1Q07837 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC3A1Q07837 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC3A1Q07837 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC3A1Q07837 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC3A1Q07837 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC3A1Q07837 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC3A1Q07837 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC3A1Q07837 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC3A1Q07837 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC3A1Q07837 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC3A1Q07837 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC3A1Q07837 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC3A1Q07837 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC3A1Q07837 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC3A1Q07837 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC3A1Q07837 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC3A1Q07837 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC3A1Q07837 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC3A1Q07837 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC3A1Q07837 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC3A1Q07837 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC3A1Q07837 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC3A1Q07837 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC3A1Q07837 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC3A1Q07837 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC3A1Q07837 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC3A1Q07837 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC3A1Q07837 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC3A1Q07837 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC3A1Q07837 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC3A1Q07837 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC3A1Q07837 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC3A1Q07837 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC3A1Q07837 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC3A1Q07837 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC3A1Q07837 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC3A1Q07837 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC3A1Q07837 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC3A1Q07837 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC3A1Q07837 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC3A1Q07837 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC3A1Q07837 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC3A1Q07837 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC3A1Q07837 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC3A1Q07837 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC3A1Q07837 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC3A1Q07837 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC3A1Q07837 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC3A1Q07837 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC3A1Q07837 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC3A1Q07837 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC3A1Q07837 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC3A1Q07837 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC3A1Q07837 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC3A1Q07837 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC3A1Q07837 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC3A1Q07837 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC3A1Q07837 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC3A1Q07837 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC3A1Q07837 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC3A1Q07837 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC3A1Q07837 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC3A1Q07837 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC3A1Q07837 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC3A1Q07837 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC3A1Q07837 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC3A1Q07837 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC3A1Q07837 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC3A1Q07837 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC3A1Q07837 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC3A1Q07837 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC3A1Q07837 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC3A1Q07837 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC3A1Q07837 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC3A1Q07837 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC3A1Q07837 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC3A1Q07837 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC3A1Q07837 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC3A1Q07837 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC3A1Q07837 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC3A1Q07837 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC3A1Q07837 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC3A1Q07837 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC3A1Q07837 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC3A1Q07837 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC3A1Q07837 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC3A1Q07837 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC3A1Q07837 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC3A1Q07837 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC3A1Q07837 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC3A1Q07837 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC3A1Q07837 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC3A1Q07837 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC3A1Q07837 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC3A1Q07837 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC3A1Q07837 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC3A1Q07837 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC3A1Q07837 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms