Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
TOP2BQ02880 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
TOP2BQ02880 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
TOP2BQ02880 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
TOP2BQ02880 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
TOP2BQ02880 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC46.51■■■■■ 5.04
TOP2BQ02880 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC46.51■■■■■ 5.04
TOP2BQ02880 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
TOP2BQ02880 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
TOP2BQ02880 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.03
TOP2BQ02880 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC46.43■■■■■ 5.02
TOP2BQ02880 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC46.43■■■■■ 5.02
TOP2BQ02880 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.41■■■■■ 5.02
TOP2BQ02880 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
TOP2BQ02880 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC46.38■■■■■ 5.01
TOP2BQ02880 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
TOP2BQ02880 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
TOP2BQ02880 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
TOP2BQ02880 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC46.36■■■■■ 5.01
TOP2BQ02880 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC46.36■■■■■ 5.01
TOP2BQ02880 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC46.35■■■■■ 5.01
TOP2BQ02880 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC46.34■■■■■ 5.01
TOP2BQ02880 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
TOP2BQ02880 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
TOP2BQ02880 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
TOP2BQ02880 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC46.32■■■■■ 5
TOP2BQ02880 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
TOP2BQ02880 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC46.31■■■■■ 5
TOP2BQ02880 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
TOP2BQ02880 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
TOP2BQ02880 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC46.28■■■■■ 5
TOP2BQ02880 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
TOP2BQ02880 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC46.28■■■■■ 5
TOP2BQ02880 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC46.27■■■■■ 5
TOP2BQ02880 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
TOP2BQ02880 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
TOP2BQ02880 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
TOP2BQ02880 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC46.21■■■■■ 4.99
TOP2BQ02880 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
TOP2BQ02880 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC46.21■■■■■ 4.99
TOP2BQ02880 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC46.21■■■■■ 4.99
TOP2BQ02880 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
TOP2BQ02880 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC46.2■■■■■ 4.99
TOP2BQ02880 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
TOP2BQ02880 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC46.17■■■■■ 4.98
TOP2BQ02880 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
TOP2BQ02880 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
TOP2BQ02880 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC46.15■■■■■ 4.98
TOP2BQ02880 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
TOP2BQ02880 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC46.14■■■■■ 4.98
TOP2BQ02880 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC46.11■■■■■ 4.97
TOP2BQ02880 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC46.11■■■■■ 4.97
TOP2BQ02880 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC46.1■■■■■ 4.97
TOP2BQ02880 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC46.07■■■■■ 4.97
TOP2BQ02880 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC46.07■■■■■ 4.97
TOP2BQ02880 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
TOP2BQ02880 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.04■■■■■ 4.96
TOP2BQ02880 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
TOP2BQ02880 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
TOP2BQ02880 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
TOP2BQ02880 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
TOP2BQ02880 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
TOP2BQ02880 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
TOP2BQ02880 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
TOP2BQ02880 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
TOP2BQ02880 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
TOP2BQ02880 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
TOP2BQ02880 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.98■■■■■ 4.95
TOP2BQ02880 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
TOP2BQ02880 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC45.95■■■■■ 4.95
TOP2BQ02880 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
TOP2BQ02880 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
TOP2BQ02880 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC45.91■■■■■ 4.94
TOP2BQ02880 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
TOP2BQ02880 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC45.88■■■■■ 4.94
TOP2BQ02880 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
TOP2BQ02880 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC45.88■■■■■ 4.93
TOP2BQ02880 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC45.87■■■■■ 4.93
TOP2BQ02880 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.85■■■■■ 4.93
TOP2BQ02880 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
TOP2BQ02880 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.85■■■■■ 4.93
TOP2BQ02880 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC45.84■■■■■ 4.93
TOP2BQ02880 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
TOP2BQ02880 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
TOP2BQ02880 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
TOP2BQ02880 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.82■■■■■ 4.93
TOP2BQ02880 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
TOP2BQ02880 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC45.8■■■■■ 4.92
TOP2BQ02880 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC45.79■■■■■ 4.92
TOP2BQ02880 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.79■■■■■ 4.92
TOP2BQ02880 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC45.78■■■■■ 4.92
TOP2BQ02880 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
TOP2BQ02880 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC45.77■■■■■ 4.92
TOP2BQ02880 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
TOP2BQ02880 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
TOP2BQ02880 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
TOP2BQ02880 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC45.75■■■■■ 4.91
TOP2BQ02880 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
TOP2BQ02880 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
TOP2BQ02880 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms