Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MUC3AQ02505 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MUC3AQ02505 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MUC3AQ02505 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MUC3AQ02505 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MUC3AQ02505 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MUC3AQ02505 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MUC3AQ02505 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MUC3AQ02505 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MUC3AQ02505 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
MUC3AQ02505 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MUC3AQ02505 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MUC3AQ02505 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MUC3AQ02505 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MUC3AQ02505 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MUC3AQ02505 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MUC3AQ02505 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MUC3AQ02505 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MUC3AQ02505 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MUC3AQ02505 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MUC3AQ02505 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MUC3AQ02505 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MUC3AQ02505 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
MUC3AQ02505 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MUC3AQ02505 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MUC3AQ02505 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MUC3AQ02505 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MUC3AQ02505 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MUC3AQ02505 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MUC3AQ02505 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MUC3AQ02505 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MUC3AQ02505 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MUC3AQ02505 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MUC3AQ02505 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MUC3AQ02505 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MUC3AQ02505 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MUC3AQ02505 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MUC3AQ02505 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MUC3AQ02505 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MUC3AQ02505 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MUC3AQ02505 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MUC3AQ02505 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
MUC3AQ02505 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MUC3AQ02505 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MUC3AQ02505 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MUC3AQ02505 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MUC3AQ02505 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MUC3AQ02505 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MUC3AQ02505 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MUC3AQ02505 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MUC3AQ02505 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MUC3AQ02505 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MUC3AQ02505 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MUC3AQ02505 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MUC3AQ02505 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MUC3AQ02505 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MUC3AQ02505 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MUC3AQ02505 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MUC3AQ02505 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MUC3AQ02505 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MUC3AQ02505 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MUC3AQ02505 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MUC3AQ02505 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MUC3AQ02505 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MUC3AQ02505 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MUC3AQ02505 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MUC3AQ02505 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MUC3AQ02505 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MUC3AQ02505 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MUC3AQ02505 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MUC3AQ02505 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MUC3AQ02505 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MUC3AQ02505 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MUC3AQ02505 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MUC3AQ02505 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MUC3AQ02505 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
MUC3AQ02505 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MUC3AQ02505 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MUC3AQ02505 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
MUC3AQ02505 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MUC3AQ02505 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MUC3AQ02505 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MUC3AQ02505 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MUC3AQ02505 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MUC3AQ02505 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MUC3AQ02505 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MUC3AQ02505 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MUC3AQ02505 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MUC3AQ02505 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MUC3AQ02505 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MUC3AQ02505 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MUC3AQ02505 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MUC3AQ02505 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MUC3AQ02505 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MUC3AQ02505 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MUC3AQ02505 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
MUC3AQ02505 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MUC3AQ02505 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MUC3AQ02505 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MUC3AQ02505 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms