Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFRSF17Q02223 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF17Q02223 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF17Q02223 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF17Q02223 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFRSF17Q02223 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFRSF17Q02223 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFRSF17Q02223 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFRSF17Q02223 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFRSF17Q02223 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFRSF17Q02223 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFRSF17Q02223 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNFRSF17Q02223 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFRSF17Q02223 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFRSF17Q02223 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFRSF17Q02223 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFRSF17Q02223 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFRSF17Q02223 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFRSF17Q02223 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFRSF17Q02223 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFRSF17Q02223 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFRSF17Q02223 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFRSF17Q02223 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFRSF17Q02223 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFRSF17Q02223 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF17Q02223 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF17Q02223 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF17Q02223 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF17Q02223 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF17Q02223 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF17Q02223 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF17Q02223 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF17Q02223 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF17Q02223 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF17Q02223 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF17Q02223 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF17Q02223 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF17Q02223 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF17Q02223 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF17Q02223 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF17Q02223 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF17Q02223 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF17Q02223 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNFRSF17Q02223 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNFRSF17Q02223 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFRSF17Q02223 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFRSF17Q02223 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFRSF17Q02223 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFRSF17Q02223 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFRSF17Q02223 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFRSF17Q02223 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFRSF17Q02223 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFRSF17Q02223 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF17Q02223 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF17Q02223 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF17Q02223 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF17Q02223 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF17Q02223 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFRSF17Q02223 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF17Q02223 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF17Q02223 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF17Q02223 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFRSF17Q02223 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFRSF17Q02223 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFRSF17Q02223 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNFRSF17Q02223 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF17Q02223 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF17Q02223 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF17Q02223 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFRSF17Q02223 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFRSF17Q02223 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFRSF17Q02223 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFRSF17Q02223 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFRSF17Q02223 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF17Q02223 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF17Q02223 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF17Q02223 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF17Q02223 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF17Q02223 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF17Q02223 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF17Q02223 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF17Q02223 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF17Q02223 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFRSF17Q02223 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF17Q02223 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF17Q02223 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF17Q02223 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF17Q02223 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF17Q02223 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF17Q02223 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF17Q02223 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF17Q02223 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF17Q02223 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF17Q02223 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFRSF17Q02223 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFRSF17Q02223 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFRSF17Q02223 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFRSF17Q02223 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFRSF17Q02223 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFRSF17Q02223 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms