Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BNC1Q01954 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BNC1Q01954 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BNC1Q01954 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BNC1Q01954 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BNC1Q01954 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BNC1Q01954 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BNC1Q01954 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BNC1Q01954 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BNC1Q01954 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BNC1Q01954 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BNC1Q01954 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BNC1Q01954 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BNC1Q01954 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BNC1Q01954 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BNC1Q01954 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BNC1Q01954 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
BNC1Q01954 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BNC1Q01954 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BNC1Q01954 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BNC1Q01954 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BNC1Q01954 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BNC1Q01954 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BNC1Q01954 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BNC1Q01954 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BNC1Q01954 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BNC1Q01954 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BNC1Q01954 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BNC1Q01954 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BNC1Q01954 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BNC1Q01954 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BNC1Q01954 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BNC1Q01954 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BNC1Q01954 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BNC1Q01954 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BNC1Q01954 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BNC1Q01954 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BNC1Q01954 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BNC1Q01954 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BNC1Q01954 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BNC1Q01954 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BNC1Q01954 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BNC1Q01954 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BNC1Q01954 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BNC1Q01954 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BNC1Q01954 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BNC1Q01954 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BNC1Q01954 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BNC1Q01954 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BNC1Q01954 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BNC1Q01954 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BNC1Q01954 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BNC1Q01954 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BNC1Q01954 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BNC1Q01954 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BNC1Q01954 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BNC1Q01954 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BNC1Q01954 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BNC1Q01954 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BNC1Q01954 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BNC1Q01954 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BNC1Q01954 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BNC1Q01954 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BNC1Q01954 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BNC1Q01954 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BNC1Q01954 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BNC1Q01954 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BNC1Q01954 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BNC1Q01954 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BNC1Q01954 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BNC1Q01954 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BNC1Q01954 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BNC1Q01954 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BNC1Q01954 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BNC1Q01954 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BNC1Q01954 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BNC1Q01954 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BNC1Q01954 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BNC1Q01954 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BNC1Q01954 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BNC1Q01954 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BNC1Q01954 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BNC1Q01954 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BNC1Q01954 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BNC1Q01954 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BNC1Q01954 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BNC1Q01954 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BNC1Q01954 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BNC1Q01954 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BNC1Q01954 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BNC1Q01954 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BNC1Q01954 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BNC1Q01954 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
BNC1Q01954 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BNC1Q01954 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BNC1Q01954 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BNC1Q01954 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BNC1Q01954 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BNC1Q01954 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BNC1Q01954 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms