Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1DQ01668 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1DQ01668 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1DQ01668 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1DQ01668 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1DQ01668 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1DQ01668 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1DQ01668 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1DQ01668 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1DQ01668 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1DQ01668 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1DQ01668 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1DQ01668 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1DQ01668 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1DQ01668 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1DQ01668 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1DQ01668 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1DQ01668 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1DQ01668 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNA1DQ01668 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA1DQ01668 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1DQ01668 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1DQ01668 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1DQ01668 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1DQ01668 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1DQ01668 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1DQ01668 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1DQ01668 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1DQ01668 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1DQ01668 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1DQ01668 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1DQ01668 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1DQ01668 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1DQ01668 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1DQ01668 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1DQ01668 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1DQ01668 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1DQ01668 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1DQ01668 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1DQ01668 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1DQ01668 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1DQ01668 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1DQ01668 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1DQ01668 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1DQ01668 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1DQ01668 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1DQ01668 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1DQ01668 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1DQ01668 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1DQ01668 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1DQ01668 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1DQ01668 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1DQ01668 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1DQ01668 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1DQ01668 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1DQ01668 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1DQ01668 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1DQ01668 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1DQ01668 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1DQ01668 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1DQ01668 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1DQ01668 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1DQ01668 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1DQ01668 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1DQ01668 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1DQ01668 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1DQ01668 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1DQ01668 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1DQ01668 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1DQ01668 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1DQ01668 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1DQ01668 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA1DQ01668 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1DQ01668 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1DQ01668 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1DQ01668 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1DQ01668 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1DQ01668 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1DQ01668 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1DQ01668 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1DQ01668 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1DQ01668 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1DQ01668 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1DQ01668 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1DQ01668 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA1DQ01668 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA1DQ01668 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNA1DQ01668 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1DQ01668 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1DQ01668 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1DQ01668 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1DQ01668 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1DQ01668 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1DQ01668 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA1DQ01668 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1DQ01668 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1DQ01668 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1DQ01668 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1DQ01668 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1DQ01668 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms