Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTBN1Q01082 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTBN1Q01082 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTBN1Q01082 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPTBN1Q01082 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTBN1Q01082 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTBN1Q01082 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTBN1Q01082 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPTBN1Q01082 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPTBN1Q01082 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTBN1Q01082 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTBN1Q01082 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTBN1Q01082 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTBN1Q01082 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTBN1Q01082 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTBN1Q01082 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTBN1Q01082 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN1Q01082 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPTBN1Q01082 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPTBN1Q01082 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBN1Q01082 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBN1Q01082 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTBN1Q01082 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTBN1Q01082 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTBN1Q01082 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTBN1Q01082 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTBN1Q01082 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTBN1Q01082 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBN1Q01082 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBN1Q01082 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBN1Q01082 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBN1Q01082 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTBN1Q01082 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTBN1Q01082 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPTBN1Q01082 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTBN1Q01082 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTBN1Q01082 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTBN1Q01082 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTBN1Q01082 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTBN1Q01082 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTBN1Q01082 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTBN1Q01082 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTBN1Q01082 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTBN1Q01082 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTBN1Q01082 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTBN1Q01082 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTBN1Q01082 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTBN1Q01082 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTBN1Q01082 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTBN1Q01082 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBN1Q01082 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBN1Q01082 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBN1Q01082 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBN1Q01082 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBN1Q01082 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBN1Q01082 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBN1Q01082 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBN1Q01082 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTBN1Q01082 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTBN1Q01082 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTBN1Q01082 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTBN1Q01082 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTBN1Q01082 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTBN1Q01082 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTBN1Q01082 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTBN1Q01082 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTBN1Q01082 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTBN1Q01082 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTBN1Q01082 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTBN1Q01082 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTBN1Q01082 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTBN1Q01082 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTBN1Q01082 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTBN1Q01082 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTBN1Q01082 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTBN1Q01082 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTBN1Q01082 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTBN1Q01082 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTBN1Q01082 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTBN1Q01082 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPTBN1Q01082 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPTBN1Q01082 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTBN1Q01082 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTBN1Q01082 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTBN1Q01082 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTBN1Q01082 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTBN1Q01082 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTBN1Q01082 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTBN1Q01082 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTBN1Q01082 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTBN1Q01082 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTBN1Q01082 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPTBN1Q01082 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPTBN1Q01082 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPTBN1Q01082 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTBN1Q01082 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTBN1Q01082 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTBN1Q01082 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTBN1Q01082 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTBN1Q01082 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms