Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CRB1P82279 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CRB1P82279 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CRB1P82279 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CRB1P82279 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CRB1P82279 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
CRB1P82279 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CRB1P82279 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CRB1P82279 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CRB1P82279 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CRB1P82279 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CRB1P82279 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CRB1P82279 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CRB1P82279 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CRB1P82279 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CRB1P82279 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CRB1P82279 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CRB1P82279 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CRB1P82279 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CRB1P82279 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CRB1P82279 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CRB1P82279 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CRB1P82279 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CRB1P82279 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CRB1P82279 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CRB1P82279 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CRB1P82279 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CRB1P82279 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CRB1P82279 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
CRB1P82279 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CRB1P82279 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CRB1P82279 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CRB1P82279 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CRB1P82279 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CRB1P82279 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CRB1P82279 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CRB1P82279 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CRB1P82279 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CRB1P82279 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CRB1P82279 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CRB1P82279 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CRB1P82279 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CRB1P82279 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CRB1P82279 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CRB1P82279 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CRB1P82279 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CRB1P82279 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CRB1P82279 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
CRB1P82279 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CRB1P82279 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CRB1P82279 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
CRB1P82279 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CRB1P82279 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CRB1P82279 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CRB1P82279 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CRB1P82279 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CRB1P82279 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CRB1P82279 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CRB1P82279 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CRB1P82279 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CRB1P82279 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CRB1P82279 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CRB1P82279 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CRB1P82279 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
CRB1P82279 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CRB1P82279 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
CRB1P82279 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CRB1P82279 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CRB1P82279 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CRB1P82279 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CRB1P82279 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CRB1P82279 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CRB1P82279 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CRB1P82279 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CRB1P82279 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CRB1P82279 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CRB1P82279 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CRB1P82279 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CRB1P82279 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CRB1P82279 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CRB1P82279 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CRB1P82279 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CRB1P82279 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CRB1P82279 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CRB1P82279 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CRB1P82279 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CRB1P82279 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CRB1P82279 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CRB1P82279 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CRB1P82279 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CRB1P82279 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
CRB1P82279 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
CRB1P82279 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CRB1P82279 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CRB1P82279 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
CRB1P82279 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CRB1P82279 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CRB1P82279 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CRB1P82279 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CRB1P82279 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms