Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HBG1P69891 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HBG1P69891 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HBG1P69891 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HBG1P69891 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HBG1P69891 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HBG1P69891 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HBG1P69891 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HBG1P69891 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HBG1P69891 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HBG1P69891 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HBG1P69891 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HBG1P69891 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HBG1P69891 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HBG1P69891 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
HBG1P69891 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HBG1P69891 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HBG1P69891 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HBG1P69891 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HBG1P69891 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HBG1P69891 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HBG1P69891 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HBG1P69891 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HBG1P69891 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HBG1P69891 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HBG1P69891 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HBG1P69891 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HBG1P69891 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HBG1P69891 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HBG1P69891 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HBG1P69891 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HBG1P69891 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HBG1P69891 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HBG1P69891 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HBG1P69891 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HBG1P69891 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HBG1P69891 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HBG1P69891 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HBG1P69891 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HBG1P69891 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HBG1P69891 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HBG1P69891 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HBG1P69891 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HBG1P69891 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HBG1P69891 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HBG1P69891 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HBG1P69891 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HBG1P69891 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HBG1P69891 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HBG1P69891 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HBG1P69891 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HBG1P69891 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HBG1P69891 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HBG1P69891 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HBG1P69891 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HBG1P69891 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HBG1P69891 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HBG1P69891 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HBG1P69891 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HBG1P69891 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HBG1P69891 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HBG1P69891 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HBG1P69891 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HBG1P69891 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HBG1P69891 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HBG1P69891 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HBG1P69891 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HBG1P69891 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HBG1P69891 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HBG1P69891 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HBG1P69891 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HBG1P69891 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HBG1P69891 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HBG1P69891 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HBG1P69891 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HBG1P69891 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HBG1P69891 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HBG1P69891 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HBG1P69891 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HBG1P69891 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HBG1P69891 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HBG1P69891 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HBG1P69891 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HBG1P69891 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HBG1P69891 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HBG1P69891 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HBG1P69891 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HBG1P69891 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HBG1P69891 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HBG1P69891 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HBG1P69891 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HBG1P69891 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HBG1P69891 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HBG1P69891 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HBG1P69891 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HBG1P69891 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HBG1P69891 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HBG1P69891 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HBG1P69891 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HBG1P69891 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms