Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS29P62273 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS29P62273 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS29P62273 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS29P62273 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS29P62273 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS29P62273 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS29P62273 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS29P62273 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS29P62273 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS29P62273 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS29P62273 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS29P62273 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS29P62273 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS29P62273 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS29P62273 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS29P62273 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS29P62273 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS29P62273 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS29P62273 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS29P62273 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS29P62273 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS29P62273 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS29P62273 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS29P62273 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS29P62273 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS29P62273 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS29P62273 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS29P62273 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS29P62273 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS29P62273 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS29P62273 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS29P62273 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS29P62273 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS29P62273 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS29P62273 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS29P62273 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS29P62273 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS29P62273 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS29P62273 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS29P62273 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS29P62273 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS29P62273 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS29P62273 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS29P62273 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS29P62273 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS29P62273 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS29P62273 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS29P62273 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS29P62273 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS29P62273 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPS29P62273 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS29P62273 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS29P62273 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS29P62273 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS29P62273 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS29P62273 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS29P62273 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS29P62273 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS29P62273 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS29P62273 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS29P62273 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS29P62273 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS29P62273 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS29P62273 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS29P62273 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS29P62273 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS29P62273 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS29P62273 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS29P62273 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS29P62273 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS29P62273 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS29P62273 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS29P62273 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS29P62273 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPS29P62273 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPS29P62273 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPS29P62273 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPS29P62273 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPS29P62273 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPS29P62273 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPS29P62273 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPS29P62273 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPS29P62273 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPS29P62273 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPS29P62273 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS29P62273 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS29P62273 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS29P62273 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS29P62273 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPS29P62273 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS29P62273 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS29P62273 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPS29P62273 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPS29P62273 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPS29P62273 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPS29P62273 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPS29P62273 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPS29P62273 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPS29P62273 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms